探索生技總經理寇景怡從國外基因檢測公司的經驗，談到基因檢測準確度必須提高到臨床診斷等級，達到精準治療的目的。以下為專訪摘要:
能定序基因就能做基因檢測嗎?
由於基因檢測的準確度目前還沒有官方判定標準，所以我還是持比較保留的看法。舉例來說，BRCA突變基因檢測目的是預測乳癌或卵巢癌的遺傳風險，要在BRCA1、BRCA2這兩個這麼大的基因裡找出一個致病的突變點，就如同要在一本百科全書中找出一個錯字般的繁複。技術上第一個瓶頸是必須能在短時間內將整個基因正確、完整地讀取；第二個瓶頸是要從讀取結果中找出有問題的地方，實驗室更要將讀取結果與資料庫進行比對，經過精密的計算才能找出有問題的基因位點，內行人都了解『基因變異資料庫的品質才是關鍵』。當實驗室說沒有找到變異基因，不一定代表結果真的就是陰性，因為有可能是資料庫不夠齊全所以比對不到；當實驗室說找到了變異基因(variant)，也不一定代表結果就是陽性，還要知道這個變異到底是一個致病突變基因(mutation)還是一個多型性基因(polymorphism)才能決定報告是陽性還是陰性。因此，如果沒有一個很精準的基因變異資料庫，遺傳突變基因檢測會比較難達到臨床診斷所需的精準等級。
選擇基因檢測該注意什麼
在做遺傳突變基因檢測的時候，我們要問的應該是VUS rate（Variants of Uncertain Significance）有多少？ VUS rate越低代表準確度越高，而基因檢測公司要如何降低VUS rate呢？答案是「需要一個好的基因變異資料庫」，以安吉莉納裘莉所採用的納斯達克上市公司Myriad Genetics為例，它是目前全球最大BRCA基因檢測公司，成立20年來服務對象已經超過150萬，BRCA基因檢測的VUS rate僅約0.6%-1.6%，是目前準確度最高的遺傳突變基因檢測公司。它能夠成為全球醫生信賴的基因檢測公司，主要原因是擁有數量最多、品質最高的獨家變異基因資料庫。也許你會有個疑問，不是有公共基因資料庫嗎? 為何Myriad Genetics這20年來還陸續投入將近一億美金建立自己的資料庫?但事實是，Myriad Genetics只使用自己的獨家資料庫，並不使用公共資料庫，因為連美國衛生研究院也同意公共基因資料庫的錯誤率偏高，雖然在2014年開始投入4年2400萬美金的預算在提高公共基因資料庫品質，但是目前準確度仍然不足以達到臨床診斷等級。
最新研究顯示，多基因檢測能提高30%以上的準確度
以往我們以為影響乳癌卵巢癌會不會遺傳的基因只有BRCA基因，但是越來越多證據顯示不只有BRCA基因，還有其他好幾個基因都跟乳癌卵巢癌遺傳有關聯。因此不能只看一個兩個基因，而是該有關聯的基因都檢查Myriad Genetics確定有25個基因跟8種遺傳性的癌症有密切交錯的關係，研究結果顯示，使用Myriad Genetic公司的 MyRisk多基因檢測，可以比單一基因檢測提高30%以上的檢測率。Myriad發現做BRCA但是沒有篩到的病人，如果再用MyRisk去做篩檢，發現大概有三成的人，是因為BRCA1/BRCA2以外的基因發生突變而導致乳癌或卵巢癌。
基因檢測用在精準治療
對已經罹患乳癌的人，我們用那斯達克股票上市公司Genomic Health的OncotypeDX檢測來分析乳癌復發機率與化療效益。Oncotype DX檢測報告並不是告訴病患乳癌是否會遺傳，而是分析乳癌腫瘤基因，決定乳癌腫瘤對於化療的預後評估，這就是個人化醫療的概念，所有的乳癌腫瘤都是獨一無二的，透過基因檢測才能達到精準治療的目的。研究顯示，OncotypeDX檢測結果小於18分的患者，接受化療的效益不明顯，也就是多做化療並沒有明顯降低乳癌復發機率，2015年最新的大型前瞻性(Prospective)證據顯示，OncotypeDX檢測結果分數小於11分的患者，沒做化療只做5年荷爾蒙治療的復發機率不到1%，這結果對於不想做化療的患者是很有用的證據。一般民眾有一個錯誤的觀念，以為得癌症一定要做化療，但是包括美國國家癌症聯合中心NCCN、美國臨床腫瘤協會ASCO、英國國家健康與臨床卓越機構NICE等國際醫學組織都已經正式認可醫師可以採用OncotypeDX基因檢測來決定病患是否需要接受化療。
台灣女性乳癌好發年紀比西方人早10年，發生的高峰約在45歲到55歲之間，這個年紀的女生大多照顧小孩與工作兩頭忙，一但做了化療生活一定會受到影響，所以這類的年輕乳癌患者，建議可以做基因檢測確定是否真的需要化療。
基因檢測用在伴隨式診斷
各大藥廠無不卯足全力在癌症標靶藥物的研發，顧名思義，標靶藥物就是在癌腫瘤細胞找到能阻斷生長的位點，再利用藥物加以阻斷，如同標靶一樣，直接命中紅心，以達到阻斷癌細胞生長的目的。「生命會自己找到出口」，同樣的癌細胞也會，甚至生命力比正常細胞更強，當原本的生長路徑遭遇阻斷時，它會產生突變，另啟生長路徑，這也是為什麼很多標靶藥物在使用初期有不錯的效果，但一段時間後效果卻越來越不顯著，這個時候基因檢測就可以提供重要的資訊，幫助醫師在短時間內更換藥物，找出更適合的取代藥物替換已經漸漸失效的藥物，我們稱之為伴隨式診斷。2015年Guardant Health公司宣布取得關鍵技術，能從血液檢體找出循環腫瘤細胞之游離DNA(tumor cell free circulation DNA)，從中解讀腫瘤基因並提出用藥分析，醫師可在短時間內根據液態切片(liquid biopsy)的分析結果，替病人選擇最有效的標靶藥物。
中國人有一句話叫「對症下藥」，而基因檢測的好處就是幫助醫生做到「對症下藥」。美國總統歐巴馬在2015年國情咨文演講中宣布了美國將展開一項高達2.15億美金的新計畫—精準醫療計劃（Precision Medicine Initiative），該項目資助美國癌症研究中心(NCI) 高達7千萬美元在腫瘤基因學研究，希望能開發更多更有效的腫瘤治療方法，我們也期待有更多的資金投入台灣醫療研究，同時搭配台灣的健保制度，讓健保資源做更有效的利用。
