侦探故事般的关键凶手:自私基因

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必需的基因

基因,是基本的遗传单位,生物要靠着很多基因共同表现,才能正常运作,然而同一种生物的不同基因,彼此间影响力却不相等。生物没有一些基因仍无关紧要;但假如缺乏某些基因却会导致无法生存,这类为数不少、不算罕见的基因就被称为“必需基因(essential gene)”

自私的基因

还有一种状况比较特殊,叫作“自私基因(selfish gene)”(或自私的遗传物质,selfish genetic element),许多人或许是由 40 多年前理查.道金斯的科普名作《自私的基因》知悉此一名词。

比起 40 年前,今日学界对于自私基因认识更多。自私基因广义的定义是,它本身不影响个体生存、繁衍的利益,若存在此一基因,却会增加它被传递到后代的机率。最极端的状况下,只有配备自私基因的个体才能生存,并继续繁衍后代,若是后代没有这个基因就不能存活;自私基因如此能确保自己不会被淘汰,生生不息、繁荣昌盛。

科学家已经在多种生物中,观察到自私基因存在。比方说,一些果蝇品系后代的两性比例严重失衡,雌性多过雄性,甚至极端到只有女生,没有男生(乍看之下果蝇的性别比例好像无关紧要,不过想想看,假如是人类社会的女男失衡呢?)。常用于研究的模式生物之一:秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans,也已知有个自私基因 peel-1,以及与之对抗的 zeel-1。最近科学家报告,线虫其实还有另一个自私基因,而且又与“必需基因”有关?[1][2]

看似必需,实则自私的基因

秀丽隐杆线虫有许多品系,实验室常用的是 N22,与其他同类交配、生宝宝都没有问题。然而用 N22 与夏威夷采集到的品系 DL238 进行情欲交流实验时,后代无法正常长大的机率却会大增。

进一步定序基因组后发现,成功长大的后裔,第三号染色体上头有一段,所有个体都是源自 N22,没有人来自 DL238。由于子代会随机获得亲代的 DNA 片段,所以这现象表示,所有那段序列继承到 DL238 亲代的个体,通通死掉了。

毛利小五郎。来源:Wiki

毛利小五郎。来源:Wiki

该序列中有一个已知的必需基因 pha-1,之前研究认为,它和咽部(pharynx)发育有关;令人惊讶的是,来自夏威夷的线虫 DL238 竟然没有这个基因。看来真相很清楚了,混血的线虫之所以死亡,凶手就是因为他们没有必需基因!(毛利小五郎调)

可是不对啊,必需基因的意思是,没有它就会死掉,但是 DL238 同样也是秀丽隐杆线虫,然而他们即使没有 pha-1,依然活得好好的?可见,真相显然没有这么简单。(柯南调)

自私组合:毒药与解毒剂

已经知道尽管缺乏 pha-1 会致死,却能透过抑制 3 个基因来克服:sup-35sup-36sup-37。经比对 DNA 序列后发现,DL238 线虫的 sup-36sup-37 两个基因并无变化,sup-35 基因却跟 pha-1 一样也不存在,所以缺乏必需基因 pha-1 仍然能活的理由,似乎是因为没有 sup-35。可是,为什么?

深入调查后,事情出乎意料,导致线虫死亡真正的凶手,竟然是 sup-35!当胚胎发育时,胚胎中会有继承自母体的 RNA,转译出蛋白质执行工作。而小线虫源自母体的 sup-35 基因产物却会搞破坏,让线虫无法长大。好在一般线虫拥有 pha-1 能够解决,而混血后裔的死因,是因为他们只继承到有毒的 sup-35,却没有 pha-1 救援。

案情急转直下,本来以为 pha-1 是对线虫发育不可或缺的必需基因,这下却发现它其实对发育不重要,实际功能反而是让带有自私基因的个体-也就是每一只线虫,能顺利活下去。sup-35pha-1,形成了一对超级自私的组合。

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仿佛侦探故事的情节:主人大宴宾客,想要谋害其中一人,却又不想自己受到怀疑,于是主人把毒药加进主菜,让每位参加者,包括自己都能吃到,再安排加入解毒剂的甜点,使每位宾客都能没事,除了没能吃到甜点的被害者以外。

因为自私,变得必需,这种案例还有多少?

自私基因演化出各种方式,让自己比其他遗传物质,有更高机率被世世代代传承下去,而 sup-35 pha-1 是个特殊的例子。

sup-35 作用如此极端的自私基因,原本命运必定是遭到淘汰,因为遗传到这款“毒药”的线虫必死无疑,根本无法正常长大,遑论散布到整个族群。然而,有了“解毒剂”pha-1 就不一样了,只要线虫同时配备一套毒药与解毒剂,小线虫就能健康快乐的长大、生小孩,接着继续将毒药与解毒剂世代传承下去,让整个族群成为自私基因的载体。

这么奇特的状况,是如何产生的?

搜寻各地的秀丽隐杆线虫后,研究者发现,还有美国加州的 QX1211,以及新西兰奥克兰 ECA36 的 2 个品系,状况和夏威夷的 DL238 一样,都没有 sup-35pha-1。有趣的是,其他种线虫也都没有这 2 个基因,意谓这对毒药与解毒剂,是在秀丽隐杆线虫与亲戚们分家以后,才独自演化出的特征。

此一发表于顶尖期刊《Science》的论文,作者最后提出至少 2 点启示。第一,秀丽隐杆线虫是模式生物,普遍用于各式研究目的,许多研究者早已习惯用它回答,与解释千变万化的问题。然而若是只专注于实验室的惯用品系,没有野外采集,不可能取得如此惊喜的重大发现。研究自然族群的变异,仍有很高的学术价值

第二透过改造基因后,观察胚胎能否继续顺利发育,科学家侦测到数目非常多的必需基因。然而这些基因,是真的有其发育、生理或其他关键的功能而必需,亦或只是如 pha-1 般,是由于其解毒剂的效果才显得不可或缺?这是值得继续深究的问题。

文  /  寒波

延伸阅读:鸡排的起源?从古 DNA 探索鸡的驯化与育种过程

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参考文献:
1.Ben-David, E., Burga, A., & Kruglyak, L. (2017). A maternal-effect selfish genetic element in Caenorhabditis elegans. Science, eaan0621.
2.Poisons, antidotes, and selfish genes

(作者部落格《盲眼的尼安德塔石器匠》、同名的粉丝团《同名的粉丝团》,欢迎参观、拍打、与喂食)

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