图尔思导入 PacBio、Nanopore 定序平台!瞄准三代定序市场

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12 月 16 日,图尔思生技(BIOTOOLS)宣布同时引进先进与最大通量的第三代基因体定序仪,透过携手 Pacific Biosciences(PacBio) 与 Oxford Nanopore Technologies(ONT)导入能读取长片段序列、迅速、准确率高且无需 PCR 扩增的三代定序仪,打造全台最大的三代定序中心,推动台湾生技领域临床研发。

2025 年市场规模将成长 3 倍

现场的台湾精准医疗及分子检测产业协会理事长李钟熙指出,从 2019 到 2025 年,全球基因定序市场的年成长率是 20.9%,且预计 2025 年将成长至 243 亿美元,比 2019 高出 3 倍。

李理事长说到,NGS 如同刚起步的大型电脑,在技术与应用上还有不少进步空间,反而三代定序则能用更自然的方式观测基因组,也无需 PCR 扩增就能做单分子即时定序,解决了过去实验室因检测片段太短难以读取、无法确知短序列从何而来的挑战。

台湾精准医疗及分子检测产业协会理事长李钟熙

导入 2 大三代定序平台

图尔思本次导入 PacBio 的 Sequel II 与 ONT 的 PromethION 2 种三代定序装置。其中 

Sequel II 定序最多仅 30 小时,且通量是 Sequel 的 8 倍。PacBio 的单分子即时定序(SMRT)更是目前市面上唯一可比肩桑格定序(Sanger sequencing)与短读序(Short read)定序准确度的长读序定序技术,能完整检测重复序列区域与复杂基因区域。

而 PromethION 是 ONT 最高通量的三代定序装置,不仅具备即时、长读长(500 bp-4 Mb)、直接定序等特点,一次最多可运行 48 个定序芯片,并可达到最高通量(6.2-12.4 TB),适合如人类、动植物及微生物等基因体的大规模研究。

三代定序 3 点优势

相比二代定序,图尔思生技总经理刘君豪指出三代定序的 3 大优势。

一是分辨率,如表皮葡萄球菌与金黄色葡萄球菌在分辨率不好的状况下难以分辨,这容易使医生做出错误判断,无法对症下药。二是完整度,二代定序可能出现片段缺失、结构变异,三代则能有效避免。三是数据库完整度,人类在微生物基因定序上的研究还太少,且有许多片段是二代定序无法比对,微生物对人类健康、疾病影响重大,三代的出现将能有效组建微生物基因数据库。

图尔思生技总经理刘君豪

扩大定序范围,却维持准确度

从三代定序设备开发商角度,PacBio 亚太区总裁兼总经理牟德宜指出,Sequel II 搭载了全球目前最准确的单分子定序技术 HiFi Reads,能在定序 1.5 万 bp(二代定序的 100 倍)下维持 99.9% 的准确度。

PacBio 亚太区总裁兼总经理牟德宜

加速台湾地区人类全基体研究

Oxford Nanopore Technologies 台湾代理商腾达行企业董事长曾荣烩则表示,很高兴能有机会首次将 ONT 旗下最大通量的定序产品 PromethION 借由与图尔思的合作引进台湾市场,加速台湾在人类全基体研究的进程,带动精准医疗产业的发展。

Oxford Nanopore Technologies 台湾代理商腾达行企业董事长曾荣烩
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