谁是致癌老鼠屎? BRCA1 单核苷酸变异告诉你!

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在过去的十年中,仅在美国就有数百万妇女对其 BRCA1 基因进行了定序,因为BRCA1 基因与 DNA 修复有关,被视为一种肿瘤抑制基因,当它的某些位点突变时,女性罹患乳癌和卵巢癌的风险就会大幅度提升。如果健康女性提早接受 BRCA1 基因检测,并且发现该基因突变,透过手术或更频繁的检查,就能大大降低她们罹患癌症的风险。然而,但目前已知的 BRCA1 基因突变就有数千种类型,而且人类对于该突变与癌症风险的影响仍不清楚。

9 月 12 日,由 Jay Shendure 教授和 Lea Starita 教授所率领的华盛顿大学医学院基因体科学系研究团队于《Nature》发表一篇文章指出,他们透过饱和基因体编辑方法(saturation genome editing)分析将近 4000 种 BRCA1 基因变异与癌症风险的相关性,将能帮助医师更精准地诊断女性罹患乳癌或卵巢肿瘤风险。

该研究团队在没有功能性 BRCA1 蛋白的死亡细胞中,使用 CRISPR-Cas9 让 BRCA1 基因中的 13 个具有重要编码功能的外显子(exons)产生单核苷酸位点突变(single-nucleotide variants, SNV),然后再分析有哪些细胞存活。结果显示,大约 72% 的 SNV 对 BRCA1 蛋白没有有害影响,不会导致乳癌或卵巢癌。大约 20% 的 SNV 则对 BRCA1 蛋白质造成损害,损害其 DNA 修复能力,进而增加患癌症的风险。

该研究团队共花费六个月的时间来测试近 4000 个突变,但他们不因此而满足,仍持续扩展该研究,期望在几年内能完整研究全部 BRCA1 基因位点突变,未来也能继续研究其他癌症风险基因,例如 BRCA2。该研究第一作者 Greg Findlay 博士也对此表示,他们将 BRCA1 基因关键区域的所有可能变化,分类为或使它能像致病突变。此外,他们也正在透过 Brotman Baty 数据库快速发布新的可用变异讯息,以帮助患者和临床医生试图找出检测结果可能的临床意义。

在该研究发表之前,科学家和临床医师只能检查几种不同的突变,现在则能透过基因编辑成无数版本的方法,使大家更容易理解 DNA 的功能,让精准医疗更精准!

延伸阅读:BRCA 1/2 基因检测标准 全球大不同

参考资料:
1. Nature, 2018. https://doi.org/10.1038/s41586-018-0461-z.
2. https://newsroom.uw.edu/news/thousands-breast-cancer-gene-variants-engineered-and-analyzed
3. https://www.nature.com/articles/d41586-018-06665-x

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