CRISPR 基因编辑获诺贝尔化学奖之后:癌症和遗传性疾病治疗、异种器官移植进展?

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10 月 7 日,加州大学伯克利分校 Jennifer A. Doudna 教授和法国微生物学专家 Emmanuelle Charpentier 博士荣获 2020 年诺贝尔化学奖殊荣!她们发现 CRISPR/Cas9 基因编辑系统,可高度精度地改变动物、植物和微生物的 DNA;借由编程基因密码,可为癌症带来创新的疗法,并有可能治愈遗传性疾病,重新改写人类的遗传密码,展开医学与生命科学研究领域从所未有的新篇章。

CRISPR 起源:古细菌的防卫系统

CRISPR 的全名是“常间回文重复序列丛集/常间回文重复序列丛集关联蛋白/群聚且有规律间隔的短回文重复序列”(clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated proteins),主要为一种存在于大多数细菌与所有的古细菌中的后天免疫系统,负责消灭入侵的外来质体或者噬菌体,在所有原核生物的重复 DNA 序列中 CRISPR 似乎是最为普遍的一种重复 DNA 序列家族。2002 年Ruud Jansen 所带领的研究团队以英文字母缩写组合出 CRISPR 的称号来为这区段命名。CRISPR/Cas 的复合式结构包含两个部份,第一个是 CRISPR,这是一段排列奇特的 DNA;第二个是 Cas,是一种核酸酶。这两者组合起来就成为一套 DNA 编辑系统。

Doudna 教授、Charpentier 博士与 CRISPR 的美丽邂逅

2006 年,Doudna 教授在在加州大学柏克莱分校(University of California, Berkeley)同事 Jillian Banfield 的引领之下首度认识了 CRISPR,让她开始对于这个发生在古微生物的有趣现象感到兴奋且深深着迷,但实际上当时她因为研究室的资源和人力不足,险些放弃了这项崭新而高风险的 CRISPR 研究。然而,在 Jillian Banfield 的强力鼓吹之下,再加上团队有新的博士后研究员威登赫夫特 Blade Wiedenheft 的加入,让 Doudna 教授决定放手一搏,决心投入探索 CRISPR 神秘机转的谜团。

2011年,Doudna 教授因缘际会认识了 Emmanuelle Charpentier 博士,二人相谈甚欢一拍即合地决定开始合作。Emmanuelle Charpentier 从化脓性链球菌的感染机制确认是以第 II 型 CRISPR 系统来切断病毒 DNA,其中 csn1 基因扮演非常关键的角色(Csn1 曾有过许多名字,直到 2011 年夏天才被正式命名为 Cas9)。她们一致认为 Cas9 蛋白可能在第 II 型 CRISPR 系统的免疫反应期间,担任破坏病毒 DNA 的关键要角。

基因神剪 CRISPR-Cas9 诞生

2012年,Doudna 教授和 Charpentier 博士合作,尝试把 CRISPR RNA 和 tracrRNA 接合起来,变成一条合成的单股 RNA,称 sgRNA,大幅简化了制作 CRISPR / Cas9 的过程。

他们的 CRISPR-Cas9 基因编辑系统是由 2 段 RNA (CRISPR RNA 和 tracrRNA)和切割酵素酶蛋白 (Cas9)所组成的复合式结构,CRISPR RNA 和 tracrRNA 扮演着导航者的角色,带领着 Cas9 蛋白复合体找到病毒的 DNA序列进而将其切割分解。其中,CRISPR RNA 是一段约 20 个核苷酸长度的 RNA 序列,透过序列互补来辨认目标 DNA 的位置,让 Cas9 蛋白进行双股 DNA 切割裂解(Double Strand Break),进而透过细胞本身的自然 DNA 修复机制或是给予人工的外源 DNA 片段作为模板,对于目标 DNA序列进行修补或是编辑。

该研究成果旋即发表在《Science》期刊,并且在隔年的一月份发表了 CRISPR 基因编辑在人类细胞的研究成果,不仅奠定 CRISPR/Cas9 成为基因编辑的重要里程碑,更点燃 CRISPR 基因编辑研究/应用领域群雄并起的烽火。

延伸阅读:CRISPR 基因编辑教母 Jennifer A. Doudna 访台演讲

CRISPR 治疗癌症和遗传性疾病? 静待更进一步的临床结果

2019 年 11 月,一项第 1/2 期临床试验结果指出,透过 CRISPR/Cas9 疗法 CTX001 编辑胎儿血红素(fetal hemoglobin)弥补一位输血依赖性 β 地中海贫血(transfusion-dependent beta thalassemia TDT)病人与另一名镰刀型红血球疾病(sickle cell disease, SCD)病人的携氧蛋白缺陷,改善其供血系统。另外,同年 10 月,中国科学家利用 CRISPR-Cas9 基因编辑造血干细胞的 CCR5 基因,以治疗爱滋病合并急性淋巴性白血病(acute lymphocytic leukemia, ALL)病人。美国宾州大学进行的另一项第 1 期临床试验,使用 CRISPR 编辑 T 细胞的 TCRα、TCRβ 和 PD-1 等三个基因并使它们失活,然后再将其送回癌症病人体内,期望能帮助免疫系统抑制癌细胞的生长。上述临床试验,都可能在 2020 年年底有更进一步的结果发表,值得关注。

CRISPR 编辑异种器官移植于人体可望进入人体试验

不仅疾病治疗,CRISPR 也能应用于异种器官移植领域,透过 CRISPR 编辑动物器官,降低免疫排斥,以替代人体器官或组织,有望缓解人类肝脏、心脏和其他器官的长期短缺。例如,哈佛医学院以及麻省理工学院(MIT)的George Church 教授利用 CRISPR 剔除所有猪内源性逆转录病毒(Porcine endogenous retrovirus, PERVs)的基因片段,也更对抗体反应、补体反应、细胞免疫反应等相关的基因进行编辑,解决免疫相容性问题,让这些猪只的器官有机会应用于人体移植。综合以上,该策略的新型临床试验将于 2021 年启动。

延伸阅读:基因编辑神手—合成生物学之父 George Church 访台

期盼 CRISPR 越来越成熟与安全

期待 2020 年年底,有更多研究和临床试验是能证实 CRISPR 基因编辑技术越来越成熟与安全,以治疗人类相关疾病,改善整体生活品质。

首图来源:https://www.nobelprize.org/prizes/chemistry/2020/summary/

延伸阅读:基因编辑应用于临床治疗首例!Vertex 和 CRISPR 贫血患者治疗结果良好

参考资料:
1. https://www.nobelprize.org/prizes/chemistry/2020/summary/
2. Science; Policy Scientific Community; doi:10.1126/science.aba7346
3. https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT03399448?term=CRISPR&draw=2
4. N Engl J Med 2019; 381:1240-1247 doi:10.1056/NEJMoa1817426
5. http://www.tang-prize.org/owner.php?cat=11&y=3

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