广泛标靶异常 RNA 片段,DNAzyme 成基因疗法新契机!

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DNA 是大家熟悉的双股螺旋遗传物质,而透过人工合成方式,单股 DNA 能与酵素组成巨分子 DNA 酵素(DNAzyme)。DNAzyme 是一种催化酵素,至今仍未在生物体中被发现,但它具有和核酶(ribozyme)类似可催化 RNA 降解、合成反应的功能,并且较核酶更加稳定。

DNAzyme 催化位点的双臂结构由大约 15 个核酸单元组成,其特色是只要修改双臂核酸序列,就能够标靶任何 RNA 序列,具有治疗 RNA 变异相关疾病的临床潜力。

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德国杜塞道夫大学(Heinrich Heine University Düsseldorf)近期发表于《Nature》的突破性研究,探讨  DNAzyme 催化 RNA 的细部分子机制。他们以核磁共振(Nuclear Magnetic Resonance, NMR)光谱法观察反应过程,此发现距离 DNAzyme 的临床应用又更近一步。

结构可塑性、镁离子辅助催化影响活性关键

自从 DNAzyme 于 20 多年前首次人工合成以来,至今医疗场域却应用有限的一大原因,是其虽然在体外作用标靶 RNA 分子的效率极佳,但进入人体细胞后却无法达成同样效果,再加上科学家对于 DNAzyme 的基础分子结构所知不多,因此难以开发改良的 DNAzyme 疗法。

此研究团队透过核磁共振光谱法,分析 DNAzyme 裂解 RNA 作用时的三维结构,发现 DNAzyme 催化位点会与 RNA 结合并包裹 RNA 片段、将其切割为两个单元。

其中影响 DNAzyme 活性有两元素,分别是其结构可塑性,以及镁离子催化作用。这些因素使 DNAzyme 与 RNA 结合更有效率,并且反应完成后短时间内又能与新的 RNA 片段结合,进行另一催化反应。

持续提升镁离子亲合度以开发基因疗法

研究团队将持续以细胞试验、类器官测试 DNAzyme 在活体的作用形式,并借由提升其与镁离子结合亲合度,增加其反应活性。未来 DNAzyme 的临床应用范畴可涵盖神经退化性疾病与癌症。

帕金森氏症(Parkinson’s disease)而言,即是因为患者脑内特定 mRNA 功能异常,造成 α-synuclein 过度累积及神经病变;癌症肿瘤细胞的 mRNA 也与正常细胞有所不同。 透过 DNAzyme 标靶异常 RNA 片段,将为这些疾病的基因疗法展开新一页治疗方式。

延伸阅读:首度可在细胞外复制 DNA 基因组,人工合成细胞成真不远了!

参考资料:
1. https://www.hhu.de/en/news-article/dnazymes-how-active-dna-molecules-with-therapeutic-potential-work
2. Nature, 2021; https://www.nature.com/articles/s41586-021-04225-4

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