近日，一些臨床研究已證實武漢肺炎（COVID-19）感染個體的糞便中存在 SARS-CoV-2 RNA和/或 SARS-CoV-2。對此，美國食品藥物管理局（FDA）也於 3 月 23 日提出安全性警示，SARS-CoV-2 可能會透過微菌叢植入治療（fecal microbiota for transplantation, FMT）進行傳播，儘管這種傳播的風險尚不清楚。
為了解決這一風險，FDA 建議在 2019 年 12 月 1 日之後所捐贈用於 FMT 的糞便，無論是根據新藥臨床試驗（investigational new drug, IND）或 FDA 的執法自由裁量權政策作為研究的一部分使用，都應嚴加管控並且給予以下保護措施。
1. 進行捐贈者篩查，並提出辨認或找出先前或最近感染 SARS-CoV-2 的捐贈者的問題。
2. 盡可能對捐贈者和/或其糞便進行 SARS-CoV-2 篩檢。
3. 根據篩檢，制定排除捐贈者和其糞便的標準。
4. 患者的知情同意書（informed consent）應包括有關可能透過 FMT 傳播 SARS-CoV-2 潛力和風險的資訊，如從無症狀患者的 COVID-19 所提供的糞便中製備的 FMT。
FDA 也正在通知 IND 負責人，所有 FMT 傳播 SARS-CoV-2 的潛在風險以及 FDA 確定執行的相關安全保護措施。
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衛生福利部在 2018 年 9 月施行醫療技術檢查檢驗醫療儀器施行或使用管理辦法（特管法），開放 FMT 用於臨床反覆性或常規治療無效之困難梭狀桿菌感染之病人。
相對於其他國家的疫情，台灣算是控制得相當好。然而，小心駛得萬年床，也建議台灣衛福部也能先擬好 FMT 臨床應用前的相關保護措施。
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1. https://www.fda.gov/vaccines-blood-biologics/safety-availability-biologics/safety-alert-regarding-use-fecal-microbiota-transplantation-and-additional-safety-protections
2. https://www.vghtpe.gov.tw/News!one.action?nid=5887
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