史上最大规模!人体微生物基因体图谱诞生

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人类约有 60 兆个细胞,存在人体内脏、口腔、皮肤和身体其他部位与我们共生的微生物却数百兆。人类已知约 2 万多个的蛋白质编码基因和 2 万多个非编码基因。那人体微生物到底有多少基因,仍是一个大问号。

8 月 14 日,哈佛医学院的研究团队发表至止最大规模的人类微生物体基因分析,也是第一个包含口腔和肠道内微生物基因的研究,他们预估微生物基因应该远超过 10 亿兆个。该研究结果刊登于《Cell Host&Microbe》。

该研究团队首先收集 1473 个人类口腔样本和 2182 个人类肠道样本,然后进行宏观基因组的交叉研究分析。随后,他们发现有近 4566 万 6334 个细菌基因,其中口腔微生物体中约有 2396 万1508 个基因,肠道微生物体中有2225万4436个基因。此外,他们更发现,超过一半的细菌基因(2300万)发生一次突变,使其成为独特基因“singletons”。在2300 多万个 singletons 中,有 1180 万来自口腔样本,1260 万来自肠道样本。

他们进一步分析发现,共有基因与微生物基本生存功能有关,如酶消耗和分解、能量转换和代谢。相比之下,singletons 倾向于发挥更多的特殊功能,如对抗抗生素或其他压力的能力,帮助建立微生物的保护细胞壁,保护它免受外部攻击等。

虽然少数微生物是致病原,但大多数微生物对人体是无害的,还有不少是有益的,越来越多的证据显示微生物可以作为疾病和健康的重要调控因素,例如龋齿、慢性发炎性肠病、糖尿病和多发性硬化症、癌症等。该研究提供各种微生物种类和菌株的基因资讯,可望在未来疾病研究与治疗和维持健康生活提供重要线索。

延伸阅读:肠道微生物体研究新里程碑:人体肠道芯片诞生

参考资料:
1. Nature 558, 354-355 (2018). doi: 10.1038/d41586-018-05462-w
2. Cell Host & Microbe, 2019; 26 (2): 283 DOI: 10.1016/j.chom.2019.07.008
3. https://hms.harvard.edu/news/microbial-fingerprinting

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