曾提升 Illumina 和 Helix 诊断能力!亚马逊云端运算服务(AWS)扩大适用 3 大领域

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因应 COVID-19 大流行,亚马逊云端运算服务(Amazon Web Services, AWS)于 2020 年 3 月启动 AWS 诊断开发计画(AWS Diagnostic Development Initiative),期望提供更好且更准确的诊断方式给大众。

AWS 诊断开发计画初期:开发预防和治疗 COVID-19 的诊断工具

该计画由全球 35 个研究机构、新创公司和企业参与发起。尽管最初的重点是开发预防和治疗 COVID-19 的诊断工具,但将来可能会扩展到包括其他传染病。启动此计画的理由有三点:第一,对于任何有效的大流行因应策略,准确的检测都是矛头。其次,历史上诊断学研究的资金不足,并且优先重点放在疫苗上,因此没有优先考虑诊断。第三,从事诊断工作的组织需要可靠且可扩展的演算能力,该公司可以将其顶尖分析和机器学习服务一起提供给他们,以便他们能够处理和分析大型数据并快速进行反复运算。

在该计画第一阶段,AWS 帮助了87 个组织,涵盖非营利组织、研究机构到新创企业和大型企业。

他们主要提供抗体分子检测,诊断影像和穿戴式装备以及使用人工智能和机器学习来检测病毒的数据分析工具等项目提供了 800 万美元奖励。

Illumina 透过次世代定序(NGS)加快了病毒突变的鉴定

其中,AWS 诊断开发计画帮助 Illumina 于 2020年 4月发布了其 SARS-CoV-2 数据工具,包含许多专用于在其 BaseSpace Sequence Hub 上分析 COVID-19 检体的应用程序,该 Hub 在 Amazon Elastic Compute Cloud(EC2)上运行,并且提供研究人员免费使用六个月。

因此,Illumina 至今已帮助800多个用户在其不同应用程序中处理了病毒测序样品。随着到 2020 年底基因体监测变得更加突出,且公卫专家追踪已知和新兴的可病毒变体,并且提升防疫决策能力,该工具包的 DRAGEN COVID Lineage应用程序(用于辨识病毒基因体中的突变)也已迅速升级。

提升 Helix 在美国 COVID-19 高灵敏度的检测能力

另外,Helix 已经在 AWS 建立软件平台,正在迅速扩大美国的公共卫生系统、雇主、政府和其他组织的 COVID-19 高灵敏度分子检测能力。该检测也取得 FDA 紧急使用授权,现在每天在美国美国处理 10 万多个 COVID-19 检测。

该计画适用范围扩大为 3 大领域

AWS 也宣布,从 2021 年 4 月 12 日开始,该计画项目范围扩大到 3 个新领域:
1. 早期疾病检测
2. 辨识个人和社区一级的疫情
3. 以更好地了解疾病轨迹和公共卫生基因体学,以加强病毒基因体定序。

AWS 将把剩余的 1200 万美元资金用于 COVID-19 项目以及专注于其他传染病的工作。若企业和组织可以在 7 月 31 日提出申请,AWS 将优先审查。

延伸阅读:JP Morgan 系列报导:Illumina 推泛癌和生资分析平台、Thermo Fisher 提 3 大战略

参考资料:
1. https://www.aboutamazon.com/news/aws/aws-launches-global-initiative-to-accelerate-covid-19-diagnostics-research-and-testing
2. https://www.aboutamazon.com/news/aws/cloud-powered-diagnostic-tools-are-critical-to-fighting-covid-19?linkId=116028199

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