分子胶降解剂是什么? 竟能杀死癌细胞?

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不像大多数传统药物直接抑制分子标靶的作用,分子胶降解剂(molecular glue degrader)则是透过泛素-蛋白酶体系统(ubiquitin-proteasome system)破坏标靶蛋白来达成杀死癌细胞的目的。其中,多发性骨髓瘤药物 lenalidomide 就是一种分子胶降解剂,透过招募 E3 泛素连接酶(ubiquitin ligase)来标记细胞中的目标蛋白,以便随后降解它。

近日,由 Dana-Farber 癌症研究中心医学肿瘤学系、瑞士 Friedrich Miescher 生物医学研究所、德国癌症研究中心的研究人员组成的团队发现,细胞周期蛋白依赖型激酶(cyclin-dependent kinases, CDK)抑制剂 CR8 也是分子胶降解剂,能降解细胞周期素 K(cyclin K),进而杀死癌细胞。相关研究刊登于《Nature》。

该研究团队首先分析来自于布罗德药物利用中心的 4518 种临床和临床前药物和化合物的数据,然后找出能杀死具有较高 E3 泛素连接酶表现的癌细胞的药物。然后,他们发现 CR8 能诱导 cyclin K 降解来杀死癌细胞,而 cyclin K 是 CDK12 的结合伙伴。CR8 像分子胶一样,结合 CDK12-cyclin K,并招募 DDB1,随后招募 E3 泛素连接酶复合物的其他部分,尽而标记 cyclin K,以便随后遭受降解。

再来,他们分析 CR8 诱导蛋白复合物的关键成分结晶体结构,进而揭露所有胶合在一起的新分子之间的相互作用。

另外,他们研究一种与 CR8 结构相似的药物活性,发现它不会导致 cyclin K 降解。这 2 种化合物之间唯一的结构差异是一个称为吡啶取代基(pyridyl substituent)的化学基团向外突出来。他们得出结论,这个化学基团足以使得 CR8 像分子胶降解剂一样发挥功能。因此,对抑制剂的外向部分进行化学修饰,可以将它们变成针对特定蛋白标靶的分子胶降解剂。

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参考资料:
1. Nature (2020). DOI: 10.1038/s41586-020-2374-x
2. https://medicalxpress.com/news/2020-06-member-drug-family-undruggable.html

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