高度微衛星體不穩定性（microsatellite instability-high，MSI-H）為癌症遺傳變異的特徵，主要發生原因是細胞在分裂過程中，修復錯誤的 DNA 序列有缺陷，導致微衛星體產生重複序列。
近日，Caris Life Sciences 指出，與目前的方法相比，使用次世代定序（next-generation sequencing，NGS）來檢測癌症免疫治療候選患者的 MSI-H 狀態，可望更有效且有更高的成本效益，此研究刊登於《Cancer Medicine》期刊。
為了評估 NGS 檢測（NGS-MSI）和目前常用的標準 PCR 片段分析法（PCR-FA）檢測 MSI的有效性，該研究團隊收集 2189 個跨越 26 種癌症腫瘤類型的配對病例（其中 1108 例為大腸直腸癌）進行比較。結果顯示，在所有 26 種的腫瘤類型中，NGS –MSI 的靈敏度為 95.8％，其特異性為 99.4％。他們進一步分析發現，在大腸直癌患者中，NGS-MSI 的靈敏度高達 100%，而且其特異性也高達 99.9％。他們更進一步指出，NGS-MSI 能檢測出 23 種癌症類型的 MSI-H 狀態。此外，與 PCR-FA 最大不同之處，MSI-NGS 不需要透過正常組織與腫瘤組織進行比較，患者僅需最少的生物檢體（biopsy）就能進行 MSI-H 檢測。
在醫師指導患者是否要接受免疫檢查點抑製劑（checkpoint inhibitor）之前，評估患者的 MSI 是相當重要的。因此，該研究團隊研究 MSI 狀態與其他已知生物標記之間的關係，該生物標記包含腫瘤突變負荷（tumor mutation burden，TMB）和 PD-L1。結果顯示，在 11348 例病例中，MSI-H、高度 TMB 以及 PD-L1 陽性各佔 3%、7.7%、25.4％。然而，在 MSI-H 病例中，低度 TMB 佔 30%，PD-L1 陽性佔 26%。對所有三種生物標誌物都呈陽性佔 0.6%。值得注意的是，三種生物標記互相重疊的情形，會因癌症類型而有所差異。
Caris 醫療總監 W. Michael Korn 博士指出，傳統上，MSI 檢測需要正常和腫瘤組織，但 Caris 的 NGS 檢測只需要腫瘤組織即可進行，因此減少了患者的負擔，並縮短檢測結果往返的時間。除了 MSI 狀態，其 NGS 方法還能提供關於 TMB 以及數百種臨床相關基因改變的訊息。
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參考資料：
1. Vanderwalde A, et al. Cancer Med. 2018 Feb 13. doi: 10.1002/cam4.1372.
2. https://www.curetoday.com/articles/nextgeneration-sequencing-platform-efficiently-detects-msi-status
3. https://www.prnewswire.com/news-releases/caris-life-sciences-announces-published-results-validating-its-next-generation-sequencing-platform-to-detect-microsatellite-instability-and-comparing-immunotherapy-associated-biomarkers-across-11000-patients-300598720.html
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