登《Nature Communications》!环状 RNA ciRS-7 其实不存在癌细胞中

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环状 RNA(circular RNAs, circRNAs)是一种闭锁结构的 RNA,近几年环状 RNA 因其基因调节功能,例如吸附小分子 RNAs、与 RNA 接合蛋白(RNA-binding proteins)的交互作用、转录(transcription)、剪接(splicing)调节、蛋白质转译(translation)等获得学界深入研究。环状 RNA 也因此发现与疾病的发展高度相关,尤其是癌症。于过往研究中发现,一种名为 ciRS-7 的环状 RNA 会与抑制癌症的 microRNA-7 (miR-7) 结合并降低其效用,使癌细胞正常生长,所以环状 RNA 被视为致癌分子。

然而,丹麦奥胡斯大学(Aarhus University)研究团队首次用空间分析(spatial analyses)的方式,观察 ciRS-7 于大肠癌肿瘤的表现,发现 ciRS-7 完全不存在癌细胞中,反而高度表现于肿瘤微环境中的基质细胞(stromal cells)内。相关研究结果也于 9 月 11 日刊登于《Nature Communications》期刊。

该研究结果说明 3 件事。首先,观测到恶性肿瘤微环境内多种良性细胞表现大量 ciRS-7 的状况,可能代表 ciRS-7 会透过癌细胞建置的微环境促使癌症恶化。其次,癌细胞内无 ciRS-7 基因的现象只会出现在由致癌基因驱动的典型腺癌(classical oncogene-driven adenocarcinomas)中,其他癌症包含恶性黑色素瘤(malignant melanoma)不会有类似状况。最后,研究团队发现肿瘤微环境中癌细胞与基质细胞的比例,能反映出环状 RNA 与 mRNA 的表现比例,而这也间接证明了细胞内竞争性内源 RNA(competing-endogenous RNAs, ceRNAs)相互调节的状况

癌症研究新视角:重新审视细胞的交互作用

从研究结果来看,奥胡斯大学助理教授 Lasse Sommer Kristensen 呼吁,科学家应重新理解癌细胞与肿瘤微环境其他良性细胞的交互作用,以正确理解癌细胞增长的分子机制。

环状 RNA 近年于癌症研究大受瞩目,但由于大多研究的执行方法类似,以分析肿瘤内所有 DNA、RNA 为主,结论可能不够完善。Kristensen 教授表示,当发现 ciRS-7 不在癌细胞,而是大量出现于恶性肿瘤微环境中其他良性细胞内时,癌症研究出现了新希望与研究角度。该研究打破过往对癌细胞致癌机制的既定印象,厘清致癌分子于肿瘤内的位置与细胞种类,对肿瘤微环境研究作出重要贡献,更使科学家重新审视空间分析的重要性。

未来奥胡斯大学研究团队将往 2 方面深入探讨。一是了解 ciRS-7 为何频繁出现在肿瘤微环境的良性细胞,第二是 ciRS-7 会如何影响癌细胞微环境建置的过程,是否为直接影响。

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参考资料:
1. Nature Communications (2020). DOI: 10.1038/s41467-020-18355-2
2. https://mbg.au.dk/en/news-and-events/news-item/artikel/well-known-rna-molecule-is-not-found-in-cancer-cells-after-all/

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