东亚第一个非吸菸肺腺癌深度蛋白体学综观研究!

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根据流行病学研究显示,东亚地区的肺腺癌(lung adenocarcinoma, LUAD)是一种与众不同的疾病,其特色是从不吸菸者(尤其是女性)患病的比率高过于吸菸者。与白种人相比,东亚地区肺腺癌 EGFR 突变的频率明显更高。尽管晚期患者的标靶治疗和免疫治疗方面已取得进展,若能早期发现和预防可望大大改善临床结果,并且为患者带来经济利益。

7 月 9 日,由中研院化学所陈玉如所长、中研院杨泮池院士所组成的的研究团队于《Cell》发表了东亚地区第一个非吸菸肺腺癌的深层蛋白质体学综观研究,确定年龄、性别相关的内源性和环境致癌物致突变过程、蛋白质体资讯分类可在早期阶段区分出临床特征,以及蛋白质网络确定了肿瘤发生的生物标记以及潜在药物标靶。

该研究团队为了厘清肺腺癌在人口统计学上不同疾病分子表型的情况,他们收集台湾地区不吸菸女性肺癌的世代患者数据,进行深入的综合蛋白质体学研究。然后,他们以综合的基因体学、蛋白质体学和磷酸化蛋白质体学分析描绘了人口统计学上不同的分子属性和肿瘤进展的标记。

结果显示,突变特征分析显示了与年龄和性别相关的诱变机制,其特征是年轻女性中 APOBEC 突变特征的普遍性较高,而老年女性中环境致癌物样突变特征也过量呈现。

蛋白质体学分类有助于区分早期 EGFR 患者的临床特征突变,如 L858R 和 Del19。若能在患者第 1B 期,进行 EGFR 突变检测可能有助于患者分层,以区分高风险患者,进而进行密切随访和辅助治疗。

最后,他们也提到,蛋白质网络的从头建构不仅提供了确定每种分子亚型的生物学特征的整体视图,并且合理化了潜在药物标靶和生物标记物的选择。整合后的网络也显示,多种免疫细胞类型存在肿瘤样本中,以及免疫细胞异质性丰度,并且基质金属蛋白酶在肺腺癌进展中具有重要作用。使用独立的回顾性队列研究,他们证实了这种可药物治疗的蛋白类别与疾病预后相关。总体而言,这项研究揭示了肺腺癌早期阶段的分子结构和肿瘤进展的标记,并可望为精准医学治疗东亚非吸菸型肺癌开辟道路。

延伸阅读:AACR 2020 会议报导:肺癌标靶治疗最新突破

参考资料:Chen et al., 2020, Cell 182, 226–244

首图来源:Background vector created by macrovector – www.freepik.com

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