基因体中心系列专访(三):台湾大学基因体医学研究中心 体学(Omics)融合与跨领域对话

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基本介绍

台湾大学基因体医学研究中心(National Taiwan University Center of Genomic Medicine, 简称NTU CGM)成立于 2002 年,是医学院为配合台湾大学执行教育部推动研究型大学的整合计画所设立,为追求并提升医学卓越研究。

自 2003 年 4 月启用以来,陆续建置了 10 个核心实验室(core labs),包括蛋白体暨蛋白质功能(Proteomics);微生物基因体(Microbial Genomics);次世代定序与微阵列(Microarray);基因医学组织库(Tissue Bank);基因转殖动物(Transgenic Animal);基因剔除鼠(Gene Knockout Mouse);遗传流行病学(Genetic Epidemiology);生物资讯学暨生物统计(Bioinformatics and Biostatistics);干细胞(Stem Cell)以及代谢体(Metabolomics)核心;并设有教学资源中心,统筹人才训练储备与教学资源整合。

目前中心由张上淳院长领军,共有 92 名教职人员及博士后研究员,致力于基因体相关转译医学与精准医疗之突破性研究,以先进设施与专业平台,提供跨领域核心服务与研究协助给校内外基础与临床研究人员,服务对象除了台湾大学,还有各大医院、生技公司、中研院、工研院及其他大专院校。

中心目标与任务

  • 学术成就与全球化:整合台大医学院、公共卫生学院、医院及其他相关院所之资源,建立专业核心实验室,并促进跨领域创新研究与国际学术交流合作,提升台湾学术地位与国际竞争力。
  • 核心服务:借由高通量软硬件设备资源与专业技术之整合,提供相关领域研究人员优质服务与专业咨询,促进基因体医学及跨校、跨领域转译研究的合作与发展,促进台湾学术研究与生医产业发展。
  • 社会责任:针对台湾及亚洲地区特有癌症、感染症及流行疾病,推动转译医学相关研究与国际交流合作,期望能对基础医学与临床医疗运用有所贡献。亦促成产学合作与研究同仁之研发成果产业化。
  • 人才培育:以学术资源整合模式来培训精准医疗相关人员,透过定期举办研究性质的核心工作坊、设施说明会、暑期大专生计划与营队,建立完整校园三创生态系统,扎根学生与学术研究、生医业界接轨能力。
台大基因体中心核心实验室架构图

台大基因体中心核心实验室架构图

延伸阅读:基因体中心系列专访(二):荣阳基因体中心 肿瘤免疫与基因体的整合

重点特色

体学生资库与生物库(Omics Informatics and Biobanks),运用大数据与分析已成为生医跨领域加速发展的关键。而这也是 NTU CGM 的两大特色:

  • 跨领域整合、研究发展与服务平台:许多疾病成因复杂,单一研究难以窥见全貌。因此 NTU CGM 将各项体学与细胞组织、动物模式到族群遗传研究,作跨领域整合,全面地探索疾病的遗传基础及作用机转,推动转译医学合作,进而寻求解决之道,达到精准医疗的目标。
  • 生医大数据(big data,或称巨量资料)的产生与应用:台大致力于大数据分析与跨领域生医资讯整合(NTU-Galaxy),并和临床资料比对,提供各研究单位进行资料分析,透过庞大资料量的比对、统计、分析及妥善解释,从中取得线索及客观结果。

近年发展

NTU CGM 成立之初,正好遇上 SARS 大流行,建立的相关基础设施正好派上用场,专注于 SARS 的控管与相关医疗研究。2004 年,其他核心设施建置完整并开始营运,对于新兴感染症与国人特有癌症的控管、研究与医疗有即时性与长远的贡献。2008 年与国家卫生研究院合作,共同致力于转译医学领域。到了 2010 年,更进一步和台大医院密切合作,提供各核心实验室服务与技术咨询,将转译医学成果拓展至实际应用,解决临床医疗上未满足的需求。

NTU CGM 在 2012 年获得国科会 I-RiCE 计画补助与美国 MD Anderson 癌症研究中心一对一合作,藉国际平台与全球知名研究机构进行交流与拓展网络。2016 年,更获欧洲 Multi-national EU TRANSCAN 一对多计画(包括法国、意大利及比利时),以欧、亚洲的癌症发展为研究主轴,进行蹲点研究,提升台湾的国际声望。

研究成果

根据 2011-2015 年的统计资料,NTU CGM 每年约产出 150 篇期刊论文,约 50 篇会议论文,五年共 23 项专利技术。其中部分研究成果如下:

  • Targeting SARS 抗煞(SARS)新利器:冠状病毒基因调控机制研究,抗病毒新药研发,以期对抗病毒的早期感染。
  • Patient Survival 提升病患存活率:肺癌干细胞研究与体外培养模式,创造新颖的抗癌药筛选平台与分子标记。
  • Health Informatics 生物资讯国际性网站:微小 RNA 参与之调控途径、功能线上分析工具与全球化服务。
  • Disease Models 疾病模式系统:结合临床资源,产出病患衍生 iPS 细胞、流感与呼吸道疾病的细胞感染系统及肝癌的土拨鼠、小鼠与其他动物疾病模式。

教育

配合建立的跨领域整合、研究发展与核心服务平台及希望建立的完整校园三创业生态系统, NTU CGM 以学术资源整合模式来逐步培训精准医疗相关研究与临床人员,透过定期举办研究性质的核心工作坊、设施说明会、暑期大专生计划与营队,早日扎根学生与学术研究、生医业界接轨的能力。尤其是每年举办的暑期营队让大学生来实习,除了学习最新技术,提高学术研究兴趣,也能提早接触产业趋势,培养与产业接轨的能力。在未来,希望扩大为全球性的夏令营,增进国际知名度,培育具有国际竞争力之领导人才。

台大基因体医学中心执行长 李财坤 教授

台大基因体医学中心执行长 李财坤 教授

未来展望

李财坤教授表示,NTU CGM 的最终目标是以精准医疗为主,尤其着重于癌症与感染疾病。而台湾正站在文明病的转捩点上,生医界亦不乏优秀人才与技术,若未来能和更多顶尖研究团队合作,进行数据共享与技术上的交流切磋,不仅有助于研究发展,对台湾的国际地位也是有所助益的。在癌症精准医疗,NTU CGM 将结合预计于 2018 年完成之台大癌症医院,专注于华人特有癌症的体学研究与临床治疗,为华人与亚洲患者量身订作精准医疗。在感染疾病,NTU CGM 的自我期许是架构跨国学术合作平台,成为亚太地区一流国际水准的医学研究中心,以促成 WHO 在台湾设立 WHO Collaborative Center ,利用洽谈国际合作计画,结合台湾大学与日本的学术与临床优势,进行资源共享以促进研究与医疗突破,并建立类似泛太平洋伙伴(Trans Pacific Partnership, TPP)的生医技术与医疗平台, 邀请澳洲及东南亚各国加入,共同解决传染病扩散及医疗永续课题,进而拓展国民外交、提升台湾国际能见度与医疗交流与合作,一同为打击全球化的感染疾病贡献。

延伸阅读:基因体中心系列专访(一):成大基因体中心 从研究到临床应用

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