小分子 RNA 为长度 50-250 之间的核苷酸的 RNA，依功能可分为 microRNA、piRNAs（Piwi interacting RNAs）、tsRNA（tRNA-derived small RNA）。它在癌症、糖尿病、神经性疾病和生殖扮演相当重要的角色。然而，以前的技术是无法检测到这些小分子 RNA。
随着高通量 RNA 定序技术的进步（RNA-seq）也大大促进了小型非编码 RNA（small non-coding RNA, sncRNA）的发现，但是由于 RNA 修饰干扰转接子（adapter）连接和反转录过程，进而阻止了带有这些修饰的 sncRNA 的检测，使得目前广泛使用的 RNA-seq 的定序结果仍有不小的误差。
新型 RNA 定序技术诞生，克服 RNA 修饰限制
近日，加州大学河滨分校（University of California, Riverside）研究团队开发了一种新型 RNA 定序方法，即是透过克服 RNA 修饰中止定序来全景显示 RNA（panoramic RNA display by overcoming RNA modification aborted sequencing，简称 PANDORA-seq），来帮助人们发现许多经过化学修饰的小RNA。
PANDORA-seq 采用组合酶处理（combinatorial enzymatic treatment）来去除阻碍转接子连接和反转录的关键 RNA 修饰。
PANDORA-seq 于干细胞临床应用
该研究团队使用 PANDORA-seq 来分析体细胞重新编程为诱导性多功能干细胞时的小分子 RNA 变化，然后发现某些 tsRNA 和 rsRNA 可以影响蛋白质合成，甚至影响胚胎干细胞的谱系分化，而不是由 microRNA 主导。此结果颠覆过去的认知，即是 microRNA 主导著许多哺乳动物的组织和细胞的分化，piRNAs 则在睾丸中表现来调控并调节生殖细胞的发育。
扩大 RNA 研究视野
PANDORA-seq 可望扩大小 RNA 的研究视野，可能需要重新审查以前所有使用传统 RNA 定序的研究。该研究团队下一步想要研究 tsRNA/rsRNA 的产生方式，以及它们在干细胞中的功能，以及在发育过程中如何协调细胞命运。
延伸阅读：揪出细胞层次里的致病真凶：单细胞 RNA 定序结合微流体技术参考资料：
1. Nat Cell Biol (2021). https://doi.org/10.1038/s41556-021-00652-7
2. https://news.ucr.edu/articles/2021/04/05/new-method-expands-world-small-rnas
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