对台湾人而言，B 型肝炎不是陌生的疾病。这种传染病由 B 型肝炎病毒（Hepatitis B virus）引发，在台湾一度非常普遍，导致严重的全民健康问题，所幸靠着对新生儿施打疫苗及防制传播的防疫策略，如今台湾 30 岁以下的民众，B 肝病毒带原比例已降到很低。不过，在较年长的族群中，仍有相当比例的带原者。
古人遗骸追寻 B 肝病毒踪影
B 肝病毒肆虐的地区不只台湾，而是世界各地；年代也不只现代，可以确定有至少几百年前的古人感染过此一传染病。2012 年发表的论文指出，研究团队由来自韩国的杨州市，一具 16 世纪的木乃伊中，复原 B 肝病毒 3215 个核苷酸长的完整基因组，证实 B 肝病毒已存在于当时的韩国。[1]
随着古代 DNA 次世代定序技术的进展，古代遗传学成为探索传染病的新工具。由古人遗骸中，获取细菌、病毒、疟原虫等致病性微生物的遗传物质，不但能一窥古人的健康状况，还能研究病原经历的演化史，帮助我们更了解疾病的来龙去脉。
今年发表的论文，报告了第二个B肝病毒的古代基因组，其样本来自意大利的拿波里，一具 16 世纪的儿童木乃伊。然而这项计划本来的目标，其实是天花。[2]
无心插柳柳成荫：寻找天花意外发现 B 肝病毒
这具距今 450 年左右的木乃伊中，研究团队本来预期会见到天花病毒，因为之前对木乃伊进行生物考古学分析时，在电子显微镜下的病理特征看起来非常类似天花感染 [3]。同一研究团队不久前也曾从一具 17 世纪的立陶宛木乃伊中，取得完整的天花基因组 [4]。出乎意料的是，这回来自意大利的样本，定序后竟然找不到任何天花病毒，反倒侦测到大量 B 肝病毒的 DNA 序列。
B 肝病毒在现代并不罕见，而木乃伊中属于 B 肝病毒的遗传物质，会不会是因为取样时受外界污染呢？由几点线索看来，机率很低。本研究从木乃伊各部位取样共超过 10 处，每个样本独立定序，大部分侦测到 B 肝病毒，却没有天花病毒的 DNA 片段；另外，该木乃伊同一遗址的其他遗骸，皆没有定序到 B 肝病毒。
另一方面，古代 DNA 由于年久失修，在片段末端常见特定的损伤特征，可作为 DNA 是否源自古代，而非现代污染的判断指标。木乃伊样本的定序结果显示，不论来自 B 肝病毒，或人类的粒线体 DNA 片段，两者皆呈现类似的损伤特征。
由以上几点判断，木乃伊中发现的 B 肝病毒 DNA，确实来自 16 世纪。由这些片段能拼凑出 B 肝病毒平均覆蓋率（coverage）高达 163.8 的基因组。
电子显微镜下的 B 肝病毒。来源：Wiki。
各地 B 肝病毒的分家年代远早于 16 世纪
根据遗传差异，B 肝病毒目前可分为 10 种基因型，被称为 A 到 J 型，各自有流行的地理区分布，例如 A 型最常出现在西北欧与美国，亚洲常见 B 和 C 型，地中海一带、中东、印度则流行 D 型。
本次获得的 B 肝病毒基因型属于 D 型，考量到它来自地中海地区的意大利，表示 D 型病毒至少数百年前起已存在于该处直至今日。类似状况也见于之前发表的韩国古代 B 肝病毒，它被归类于 C 型，和今日流行于当地的基因型一致。
B 肝病毒是一种 DNA 病毒，一般印象中，病毒的基因突变率、演化速度似乎很快。令人惊讶的是，此次取得的意大利古代 B 肝病毒，尽管距今已有 450 年左右，遗传上竟然和现代的同类没什么差异（前文已解释过，该样本遭到现代病毒污染的可能性不大）。
另一方面，已知的韩国与意大利两个案例都显示，该地区数百年前古人感染的 B 肝病毒，基因型和同一地点的现代人一样。由此只能推论，如今 B 肝病毒的 10 种基因型，分家年代应该远远早于 16 世纪；然而光靠已知样本，并不足以厘清更详细的演化史。
还有一个有趣的问题：为什么之前木乃伊被病理诊断为天花？论文推测，小孩感染 B 肝病毒后，有时会导致小儿丘疹性肢端皮肤炎（Gianotti-Crosti syndrome），使皮肤形成类似天花感染的外观而造成混淆，误判疾病种类。而透过论文研究指出古代 DNA 分析，正好是调查遗骸身前罹患疾病时，避免因形貌导致误判的绝佳利器！
文 / 寒波
延伸阅读：古天花病毒掀起历史疑云参考文献：
1. Kahila Bar‐Gal, G., Kim, M. J., Klein, A., Shin, D. H., Oh, C. S., Kim, J. W., … & Spigelman, M. (2012). Tracing hepatitis B virus to the 16th century in a Korean mummy. Hepatology, 56(5), 1671-1680.
2. Ross, Z. P., Klunk, J., Fornaciari, G., Giuffra, V., Duchêne, S., Duggan, A. T., … & Poinar, H. N. (2018). The paradox of HBV evolution as revealed from a 16th century mummy. PLoS pathogens, 14(1), e1006750.
3. Fornaciari, G., & Marchetti, A. (1986). Intact smallpox virus particles in an Italian mummy of the XVI century: an immuno-electron microscope study. Paleopathology newsletter, (56), 7-12.
4. Duggan, A. T., Perdomo, M. F., Piombino-Mascali, D., Marciniak, S., Poinar, D., Emery, M. V., … & Golding, G. B. (2016). 17 th Century Variola Virus Reveals the Recent History of Smallpox. Current Biology.
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