肿瘤突变负荷（Tumor mutational burden, TMB）为衡量肿瘤细胞携带的突变量量的指标，被认为是新兴的生物标志物。近日，约翰·霍普金斯·金梅尔癌症中心 (Johns Hopkins Kimmel Cancer Center)、彭博－金梅尔癌症免疫治疗研究所 (Bloomberg-Kimmel Institute for Cancer Immunotherapy)、约翰·霍普金斯大学医学院 (Johns Hopkins University School of Medicine) 团队共同开发整合的基因组方法，并且指出该方法能助医师预测非小细胞肺癌 (NSCLC) 患者对免疫检查点抑制剂的治疗反应性。
研究人员从美国国家癌症研究所 (National Cancer Institute’s Cancer Genome Atlas) 的癌症基因组图谱数据库中评估了 3,788 份肿瘤样本（包含膀胱癌、乳腺癌、结肠癌、头颈癌、肾癌、非小细胞肺癌、黑色素瘤）及先前发表的免疫疗法研究的 1,661 份肿瘤治疗样本资料，再透过全外显子组定测序 (whole exome sequence, WES) 和靶向次世代定序 (targeted next-generation sequencing) 观察到 TMB 估计值的复杂性。然后，研究团队发现 TMB 与肿瘤纯度之间存在显著相关性——肿瘤纯度越高则与 TMB 实际值愈接近，相反地，当肿瘤纯度越低则 TMB 估计愈不凖确。
为了克服 TMB 值和样品肿瘤纯度（肿瘤数量与正常细胞数量比例）相依存而无法准确估计之限制，该研究团队根据肿瘤纯度估算每个肿瘤的校正 TMB 值，利用来自癌症基因组图谱的信息模拟了 20,000 种具有不同 TMB 水平和定序覆蓋率的肿瘤，此外，他们亦开发了综合的反应模型用以交叉分析校正后的 TMB 与病患基因组特征和其抗原呈现能力。
相关研究目前用于评估患者对免疫疗法反应的生物标记物，如检测癌细胞表面蛋白 PD-L1 浓度试验，而该检测方法也应用于更准确估计 TMB 并优化肺癌、结肠癌、黑色素瘤和其他实体瘤患者对免疫治疗反应的预测。
延伸阅读：FDA 公布肌萎缩侧索硬化症（ALS）产业开发指引 盼加速更多药物上市撰文/ Ella Chen
参考资料：
- https://www.nature.com/articles/s43018-019-0008-8
- https://www.genengnews.com/news/multimodal-genomic-predictor-of-immunotherapy-success/
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