啟動子是調控基因轉錄位置、方向和強度的 DNA 序列,在細胞生長和壽命中扮演著關鍵角色。工程化啟動子則能精準控制重組蛋白質的表達以及代謝途徑的調節,進而應用於天然產物的生物合成。傳統方法如理性設計和定向進化已奠定了啟動子工程的基礎,而近年來深度學習 (DL) 的進展則徹底革新了這個領域。

本篇綜述重點介紹深度學習技術在啟動子識別、強度預測和利用生成模型進行從頭設計的應用。我們將說明這些工具的使用方式,以及資料庫品質、特徵提取和模型架構對預測準確度的影響。此外,我們也探討了開發穩健的啟動子工程模型所面臨的挑戰和未來展望。

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原始資料來源: Cell 2025-06-04

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