人類蛋白質體計畫最新報告:已確定蛋白占 9 成

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2010 年,人類蛋白質體組織(Human Proteome Organization, HUPO)啟動「人類蛋白質體計畫」,利用大量數據,將科學家、臨床醫生、產業、機構和知識庫(knowledgebase, KB)合作夥伴聯繫起來,想要了解蛋白質之間如何交互作用,身體和環境如何影響健康,進而改變醫學的實踐方式,並且為全球合作、數據共享、品質保證和增強基因體編碼蛋白質體的準確註釋建立一個國際框架。

近日,由 HUPO 刊登於《Nature Communications》的最新研究報告指出,人類蛋白質體計畫已覆蓋了 17874 種蛋白質(PE1*),占人類所有蛋白質的 90.4%,其餘蛋白位於 PE2~PE4 階段。

*根據 neXtProt 定義蛋白分類,可分為 PE1 (已確定蛋白)、PE2(轉錄階段)、PE3(從同源性推斷)、PE4(推測存在蛋白)、PE5 (預測可疑或不確定的蛋白質)。

了解人類蛋白質體學有助於精準醫學的進步。舉例來說,基因體突變可能有助於了解更多有關癌症的資訊,但它們不一定會引起蛋白質體學變化,因此僅使用基因體數據可能有所限制。結合蛋白質體學和基因體數據,可以幫助縮小導致腫瘤形成的突變,並幫助更快地找到治療標靶。

另外,蛋白質體計畫也有助於 COVID-19 潛在療法的開發,如 SARS-CoV-2 蛋白質組和被感染細胞的蛋白質體,了解二者之間如何交互作用、改變,可望理解某些細胞和個體對 COVID-19 具有更強的適應能力。反之,另一些更弱。這些基因體無法回答上述問題。

HUPO 將持續提升人類蛋白質組計畫的蛋白質品質和數量,以及鼓勵將來建立更多的多體學研究,並促進單細胞蛋白質體學等創新技術的發展。

延伸閱讀:東亞第一個非吸菸肺腺癌深度蛋白體學綜觀研究!

參考資料:
1. Nat Commun 11, 5301 (2020). https://doi.org/10.1038/s41467-020-19045-9
2. https://cbr.ubc.ca/mapping-human-proteome/

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