曾提升 Illumina 和 Helix 診斷能力!亞馬遜雲端運算服務(AWS)擴大適用 3 大領域

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因應 COVID-19 大流行,亞馬遜雲端運算服務(Amazon Web Services, AWS)於 2020 年 3 月啟動 AWS 診斷開發計畫(AWS Diagnostic Development Initiative),期望提供更好且更準確的診斷方式給大眾。

AWS 診斷開發計畫初期:開發預防和治療 COVID-19 的診斷工具

該計畫由全球 35 個研究機構、新創公司和企業參與發起。儘管最初的重點是開發預防和治療 COVID-19 的診斷工具,但將來可能會擴展到包括其他傳染病。啟動此計畫的理由有三點:第一,對於任何有效的大流行因應策略,準確的檢測都是矛頭。其次,歷史上診斷學研究的資金不足,並且優先重點放在疫苗上,因此沒有優先考慮診斷。第三,從事診斷工作的組織需要可靠且可擴展的演算能力,該公司可以將其頂尖分析和機器學習服務一起提供給他們,以便他們能夠處理和分析大型數據並快速進行反覆運算。

在該計畫第一階段,AWS 幫助了87 個組織,涵蓋非營利組織、研究機構到新創企業和大型企業。

他們主要提供抗體分子檢測,診斷影像和穿戴式裝備以及使用人工智慧和機器學習來檢測病毒的數據分析工具等項目提供了 800 萬美元獎勵。

Illumina 透過次世代定序(NGS)加快了病毒突變的鑑定

其中,AWS 診斷開發計畫幫助 Illumina 於 2020年 4月發布了其 SARS-CoV-2 數據工具,包含許多專用於在其 BaseSpace Sequence Hub 上分析 COVID-19 檢體的應用程序,該 Hub 在 Amazon Elastic Compute Cloud(EC2)上運行,並且提供研究人員免費使用六個月。

因此,Illumina 至今已幫助800多個用戶在其不同應用程序中處理了病毒測序樣品。隨著到 2020 年底基因體監測變得更加突出,且公衛專家追踪已知和新興的可病毒變體,並且提升防疫決策能力,該工具包的 DRAGEN COVID Lineage應用程序(用於辨識病毒基因體中的突變)也已迅速升級。

提升 Helix 在美國 COVID-19 高靈敏度的檢測能力

另外,Helix 已經在 AWS 建立軟體平台,正在迅速擴大美國的公共衛生系統、雇主、政府和其他組織的 COVID-19 高靈敏度分子檢測能力。該檢測也取得 FDA 緊急使用授權,現在每天在美國美國處理 10 萬多個 COVID-19 檢測。

該計畫適用範圍擴大為 3 大領域

AWS 也宣布,從 2021 年 4 月 12 日開始,該計畫項目範圍擴大到 3 個新領域:
1. 早期疾病檢測
2. 辨識個人和社區一級的疫情
3. 以更好地了解疾病軌跡和公共衛生基因體學,以加強病毒基因體定序。

AWS 將把剩餘的 1200 萬美元資金用於 COVID-19 項目以及專注於其他傳染病的工作。若企業和組織可以在 7 月 31 日提出申請,AWS 將優先審查。

延伸閱讀:JP Morgan 系列報導:Illumina 推泛癌和生資分析平台、Thermo Fisher 提 3 大戰略

參考資料:
1. https://www.aboutamazon.com/news/aws/aws-launches-global-initiative-to-accelerate-covid-19-diagnostics-research-and-testing
2. https://www.aboutamazon.com/news/aws/cloud-powered-diagnostic-tools-are-critical-to-fighting-covid-19?linkId=116028199

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