由國家衛生研究院與臺中榮民總醫院共同開發的「PanAMR（Pan-Genomic Pathogen Identification and Anti-Microbial Resistance Diagnostic System / 泛基因體病原體鑑定與抗藥性診斷系統）」，正帶領血流感染（bloodstream infection）偵測領域，正式跨入第三代基因定序的精準醫療新篇。
PanAMR 奈米孔定序技術，爭取 48 小時黃金治療時間
結合尖端奈米孔定序技術（nanopore sequencing）與即時的生物資訊分析大幅改善整體效率。傳統診斷血流感染的標準流程仰賴血液培養，從檢體送入實驗室，病原體（1天）與抗藥性分析（3天）耗時漫長。面對敗血症等急重症，醫師往往難以精準地對症下藥。
PanAMR 平台的出現，突破了這個困境。直接從血液培養陽性的檢體中進行定序。透過搭配適配採樣（adaptive sampling）技術，能過濾掉人類 DNA 干擾。這些序列資訊會立刻與國衛院自建、並持續改善的抗藥基因資料庫進行高速比對。1 小時內，就能完成病原體鑑定；15 小時內，一份精準的藥物使用建議就能送到臨床醫師手中。相較於傳統方法，PanAMR 可為醫師和病患爭取更多黃金治療時間，讓精準用藥從理想變為可能。
驗證成果斐然，準確率獲國際頂尖期刊肯定
PanAMR 平台，在獲得臨床場域證明可行性外，也發表於國際頂尖期刊《Genome Medicine》。該成果的誕生源自於三位核心研究者共同領軍：國衛院感染症與疫苗研究所的陳逢叡副研究員，負責定序平台與臨床流程開發；國衛院群體健康科學研究所的廖玉潔副研究員，則專注於演算法的設計與抗藥性（Anti-Microbial Resistance, AMR）預測的優化；而臺中榮總感染科與感染管制中心的劉伯瑜主任，則肩負起臨床導入、驗證與成效評估。
國衛院指出，PanAMR 平台不僅能精準偵測出達 76 種常見的血流感染病原體，其抗藥性預測的準確率更高達 90.6%。而對於臨床上棘手、風險高的病原體，如肺炎克雷伯氏桿菌（Klebsiella pneumoniae）與金黃色葡萄球菌（Staphylococcus aureus），其偵測錯誤率均被控制在1.5%以下。代表 PanAMR 的精準度，已經達到美國食品藥物管理局（FDA）為診斷工具所設下的標準。劉伯瑜主任表示：「這項技術不僅是快，更重要的是它能在第一時間協助臨床醫師做出最精準的診斷，強化治療決策。特別是對敗血症與嚴重感染的病人來說，這可能是扭轉病程的關鍵。」
從臨床到公衛監測，打造臺灣精準診斷生態鏈
目前此技術平台與騰達行企業股份有限公司展開自動化流程建構的合作，並共同執行國科會產學合作計畫「開發即時血流感染症臨床輔助診斷分析與監控平台系統-真實臨床場域的應用與落地驗證」。未來除可擴展至呼吸道、泌尿道等感染領域外，也將進一步串接公共衛生監測系統，推動形成臺灣精準感染診斷生態鏈。
參考資料：
1.https://www.nhri.edu.tw/News/more?id=3653ab7d35364418b11ae59c4b825457
