核酸片段篩選更精確!有勁基因電泳平台升級實驗操作流程與數據質量

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現今臨床與研究學者在腫瘤學液態活檢(liquid biopsies)、懷孕婦女的非侵入式產前分析(NIPT)及藥物開發等實驗中,監測游離 DNA (cell free DNA, cfDNA)常用的實驗模式為以物理的方法使樣本在電泳膠體內分離,並根據片段尺寸大小篩選出特定的 DNA 片段,因此常面臨片段篩選的不夠精確,導致數據取得不夠漂亮等困境,實驗手續更是繁複耗時。

致力於開發整合基因組技術與服務以推進診斷科學的有勁基因(Yourgene Health),推出高通量、全自動化的電泳凝膠平台 LightBench®,可直接一機篩選並分析出目標 DNA 片段。其平台搭載的 Ranger® 技術還可強化樣品製備流程中的凝膠尺寸篩選(DNA size selection),將能幫助實驗人員在目標游離 DNA 偵測、腫瘤學研究、克隆(cloning)以及 NGS 等實驗的數據品質更提升,並簡化繁雜的實驗手續。除此之外,全自動化操作模式及 45 分鐘內能同時跑 12 種不同實驗樣本的高效能,是臨床研究的設備新生力軍!

提升數據質量的自動化尺寸篩選系統

腫瘤液態活檢實驗中,常遇到的樣本內的腫瘤游離 DNA 片段因尺寸過小而無法被傳統物理方法-電泳膠體內分離出,更常有偽陰性(false negative)的情形發生。有勁基因為提升腫瘤片段的取得,強化 Ranger® 技術的全自動化尺寸篩選系統,能提升 2 至 3 倍的片段匯集量,更有效增進數據結果的準確性。

(表格資訊由 YourgeneHealth 提供,基因線上製圖)

3 大優勢升級實驗流程

(圖說)市場上的同類型產品(左)的研究數據的品質通常較參差不齊;反之,LightBench® (右)以自動化尺寸篩選系統提供全面更高穩定結果,並更能根據使用者的參數設定數值,精準捕捉 DNA 片段,提供更精確的數據。

透過優化實驗結果,簡單化操作的流程, LightBench® 可幫助減少研究樣本的浪費、降低實驗成本,確保在各項臨床檢測分析如產前檢測等都能達到高穩定、高品質的結果。而 LightBench® 的 3 大優勢保證可讓實驗流程省力,數據也更漂亮!

1. 解析度提升:使用每 90 秒拍攝一張圖像的操作,在 45 分鐘的運作時間內提供 30 張圖像確保不遺漏任何 DNA 片段。除此之外,還提供最小的樣本尺寸 10 bp,並以領先業界的 +/- 5% 誤差,提升精確性至 >95%。

2. 實驗結果穩定:優於業界的高平均回收率(>70%)與高達 97% 的再現性能確保實驗結果的品質穩定。

3. 實驗流程優化:使用 30mm 的寬凝膠通道以提高 DNA 的分離能力,並在每道凝膠通道提供穩定電壓來確保跑膠速度一致。此外,還可即時修改實驗參數,並立即獲取優化的實驗結果。

Yourgene Health 的 LightBench®

有勁基因 (Yourgene Health)是一間總部位於英國曼徹斯特的生技企業,提供頂尖基因組技術與服務。於台灣台北、新加坡、美國以及加拿大都有分部,並已於倫敦證券交易所 AIM 市場以股票代碼 YGEN 上市。

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