用 CRISPR 編輯腸道菌!微生物療法降低癌症免疫療法副作用

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癌症免疫療法是近年熱門的癌症治療之一,該療法透過檢查點抑制劑,來阻礙癌細胞干擾人體免疫系統,大幅提升癌症治療品質。然而,使用檢查點抑制劑產生的毒性卻不容小覷,患者也容易出現嚴重副作用。而有趣的是,有研究指出,人體腸道菌叢中有特殊菌種與治療產生的毒性和治療結果息息相關,

德州大學安德森癌症中心(MD Anderson Cancer Center)日前與丹麥生技公司 SNIPR Biome 宣布合作,將使用 CRISPR 基因編輯技術,來開發微生物癌症療法,降低免疫療法的不良反應。

CRISPR 編輯微生物基因體的挑戰

人體複雜的微生物生態系由上兆個微生物組成,過去科學家曾透過加入好菌、減少壞菌嘗試改變微生物的組成,但發現要永久改變特定的微生物組幾乎不太可能。因此他們將腦袋動到 CRISPR 的身上,基因編輯微生物的基因體,來提升特定菌種的效能或降低種類。不過這卻面臨 2 大挑戰,一是微生物經過基因編輯後,很難生存下來;二來,腸道微生物難以在實驗室培養,所以要開發出可編輯該微生物的 CRISPR 是難上加難。

SNIPR Biome 深耕 CRISPR 編輯微生物的技術,可精準的滅除特定微生物種,同時也保持其他菌種的正常運作。

特殊微生物種與免疫療法的不良反應相關

安德森癌症中心曾在 2021 年 7 月於《Nature Medicine》發表一篇研究,分析晚期黑色素瘤患者族群,他們正使用可標靶 CTLA-4 與 PD-1 的免疫檢查點抑制劑;結果顯示有一群特殊的腸道菌與免疫不良反應高度相關,所以只要能標靶該菌種,就有望降低免疫療法的潛在毒性,進而提升患者治療品質。

本次合作一共分 2 階段,首先是釐清該腸道菌的樣貌與種類,再來是用 CRISPR 開發微生物療法,而研發重點是提升免疫療法的安全性與維持療效。該藥物預計會進行至臨床前試驗,有機會的話會進入人體試驗。

安德森癌症中心的癌症射月計畫

在安德森癌症中心的癌症射月計畫(Cancer Moonshot)中,該中心在 2021 年的後半年也與其他 2 間生技公司合作癌症療法開發,分別是美國的 Blueprint Medicines Corporation(Blueprint Medicines),以及新加坡的 Hummingbird Bioscience(Hummingbird)。

2021 年 7 月,安德森癌症中心與 Blueprint Medicines 簽下 3 年合作,以加速 CDK2 抑制劑 BLU-222 的臨床進程為目標。CDK2 與細胞週期相關,突變的 CDK2 會使癌細胞增生,且是多種癌症亞型的主要驅動因子。而 BLU-222 目前具有標靶多種癌症的能力,且有望成為該類表現最好的藥物。

BLU-222 預計會於 2022 年前半年進入第 1 期人體臨床試驗。

同時,安德森癌症中心也與 Hummingbird 啟動多年合作,將推動可標靶 VISTA 拮抗劑 HMBD-002 的臨床進度。免疫檢查點蛋白 VISTA 在多種癌症患者中被發現,可使腫瘤逃過免疫系統的攻擊,而 Hummingbird 開發的​​ HMBD-002 抗體藥可抑制 VISTA,進而讓免疫系統有效標靶癌細胞。

延伸閱讀:CRISPR 基因編輯巨頭張鋒團隊新突破 ,成果連登《Nature》、《Nature Biotechnology》!

參考資料:
1. https://www.mdanderson.org/newsroom/md-anderson-and-snipr-biome-collaborate-on-crispr-microbiome-therapies.h00-159464001.html
2. https://www.nature.com/articles/s41591-021-01406-6
3. https://www.sniprbiome.com/news-press
4. https://www.mdanderson.org/newsroom/md-anderson-blueprint-medicines-collaborate-accelerate-targeted-therapy-blu-222.h00-159462423.html
5. https://www.mdanderson.org/newsroom/md-anderson-hummingbird-bioscience-collaborate-advance-immunotherapies.h00-159462423.html

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