史上最大規模！人體微生物基因體圖譜誕生

人類約有 60 兆個細胞，存在人體內臟、口腔、皮膚和身體其他部位與我們共生的微生物卻數百兆。人類已知約 2 萬多個的蛋白質編碼基因和 2 萬多個非編碼基因。那人體微生物到底有多少基因，仍是一個大問號。

8 月 14 日，哈佛醫學院的研究團隊發表至止最大規模的人類微生物體基因分析，也是第一個包含口腔和腸道內微生物基因的研究，他們預估微生物基因應該遠超過 10 億兆個。該研究結果刊登於《Cell Host＆Microbe》。

該研究團隊首先收集 1473 個人類口腔樣本和 2182 個人類腸道樣本，然後進行宏觀基因組的交叉研究分析。隨後，他們發現有近 4566 萬 6334 個細菌基因，其中口腔微生物體中約有 2396 萬1508 個基因，腸道微生物體中有2225萬4436個基因。此外，他們更發現，超過一半的細菌基因（2300萬）發生一次突變，使其成為獨特基因“singletons”。在2300 多萬個 singletons 中，有 1180 萬來自口腔樣本，1260 萬來自腸道樣本。

他們進一步分析發現，共有基因與微生物基本生存功能有關，如酶消耗和分解、能量轉換和代謝。相比之下，singletons 傾向於發揮更多的特殊功能，如對抗抗生素或其他壓力的能力，幫助建立微生物的保護細胞壁，保護它免受外部攻擊等。

雖然少數微生物是致病原，但大多數微生物對人體是無害的，還有不少是有益的，越來越多的證據顯示微生物可以作為疾病和健康的重要調控因素，例如齲齒、慢性發炎性腸病、糖尿病和多發性硬化症、癌症等。該研究提供各種微生物種類和菌株的基因資訊，可望在未來疾病研究與治療和維持健康生活提供重要線索。

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參考資料：
1. Nature 558, 354-355 (2018). doi: 10.1038/d41586-018-05462-w
2. Cell Host & Microbe, 2019; 26 (2): 283 DOI: 10.1016/j.chom.2019.07.008
3. https://hms.harvard.edu/news/microbial-fingerprinting