延伸閱讀：NGS 基因定序龍頭 Illumina 設點台灣，強化新冠防疫與精準醫療領域次世代基因定序（Next Generation Sequencing, NGS）推動精準醫療邁入新時代，NGS 定序基因資訊有助患者接受更有治療效益的個人化醫療。NGS 定序大廠 Illumina 自從 2021 年設點台灣以來，致力提升台灣的精準醫療檢測服務發展，合作生技醫藥公司應用疾病領域除了有常見的癌症用藥，也涵蓋臨床微生物診斷（clinical microbiology）與感染控制方法。基因線上專訪智擎生技、基龍米克斯、康博醫創 3 間不同領域指標公司，分享 NGS 扮演台灣生技產業推手的多樣角色。
精準評估胰臟癌合併用藥成效
專注癌症治療領域的智擎生技過去以研發新劑型化療藥物作為其起始，如今更著力於癌症精準新藥的研發，其主力產品「安能得® Onivyde®」是一款透過微脂體技術改良用於癌症的細胞毒性藥物，於 2015 年獲得美國 FDA 藥證核准用於二線胰臟癌治療，創下台灣新藥開發史上第一個獲得美國 FDA 核准通過的癌症新藥紀錄，並持續透過國際合作大廠在其他難治型的癌症（如二線小細胞肺癌）延伸治療範圍。
多數患者被診斷出胰臟癌時多已是晚期或轉移，致使胰臟癌患者預後差、存活率低。致病機轉也尚未釐清，新藥開發難度較高。而安能得®為目前極少數核准用於二線胰臟癌的標準治療，智擎透過與多個醫學中心進行安能得®治療多項癌症的合作試驗，病人接受治療之前先搭配 Illumina 的癌症 CGP panel（TSO500）進行基因檢測，在用藥後再比照基因資訊比對用藥狀況，將治療提升到精準醫療層級。
智擎總經理王宏仁博士表示，安能得®在二線胰臟癌之外，目前已與數家醫學中心合作針對胃腸膽神經內分泌瘤等其他難治型癌症晚期患者的精準治療研究。與此同時，智擎生技持續側重在標靶新藥研發上，希望借重 NGS 的技術平台來發現並驗證 biomarkers，為更多患者提供精確的治療方案。
完整 NGS 服務加快累積癌症研究基礎
基龍米克斯以多元的基因檢測服務：NGS、三代定序、單細胞定序聞名，該公司早在 2009 年就成立 NGS 部門加速基因體學相關醫學研究，除此，近年也擴張發展癌症醫學臨床部門，旗下肺腺癌液態活檢（liquid biopsy）T790M 基因檢測，藉由採檢血液中游離癌細胞 DNA，可得知治療過程中基因是否產生抗藥性突變，陽性檢測率高於 50%。
基龍米克斯透過與 Illumina 的合作，結合液態活檢技術與 NGS 大 panel 基因檢測平台 TSO 500，能以親民價格提供癌症用藥指引有用資訊。基龍米克斯完整引進 Illumina 機台、試劑、實驗室系統，產出數據後再以 Illumina 內部軟體平台分析，有效節省檢測所需資源。
江俊奇總經理分享，採用 Illumina 系統最大的優勢，是 Illumina 提供完整服務系統：檢測後得以收集所有 raw data 並搭配軟體系統分析，不僅在國內就可輸出報告，更能在資料庫中進行交叉比對，作為醫院自行研發產品的臨床基礎。未來基龍米克斯也會持續深耕腫瘤基因組學，從癌症風險評估、標靶藥物多基因檢測等面向，擴展癌症精準醫學廣度。
臨床微生物診斷快速測得感染源
有別於常見的癌症基因檢測，康博醫創創新研發出病原體即時定序檢測技術，有效協助臨床醫師快速鑒定感染病原菌。醫院中 ICU 病人經常面臨急性感染症，過去以體液培養分析病原多需要 48-72 小時才可產出報告，有別於此，康博結合 NGS 的病原體即時定序技術可以在 24 小時內產出報告，大幅減少醫療資源浪費，提升治療品質。
為了更有效率偵測病原菌核酸序列，康博研發技術利用專利濾膜去除感染者血液樣本中的人類核酸分子。康博董事長吳夢楚博士介紹該技術的兩大核心，分別是進行前處理做到去除人類 DNA 的干擾，以及後續檢體結合 NGS 定序應用。
值得注意的是，康博檢驗資料庫包括嚴格校對過的數據庫，以及經由康博自產試劑驗證過的基礎值。搭配 Illumina 高通量分析，檢測流程能從上千種可能序列中，根據基礎值設立樣本閾值，判別出致病病毒或病原菌種類，提供醫師精準檢測報告。未來除了 ICU 患者的急性治療需求，康博也預計將檢測範圍擴大至骨脊髓夜、子宮頸黏液等感染病原分析，使更多患者族群受益於臨床微生物的精準醫療。
Illumina 設點台灣以來，除為臨床單位帶來開發基因體醫學潛力，致力以院內 NGS 檢測滿足癌症檢測、罕病治療、生殖醫學 PGS、NIPT，甚至新冠病毒定序需求。產業合作上也積極提供市場推廣、產品訓練，與生技醫藥公司建立深耕台灣的定序分析服務系統。
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