模擬大腦時空環境,讓新語言模型 BrainLM 擁有多疾病預測能力

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貝勒醫學院(Baylor College of Medicine)與耶魯大學的研究團隊利用生成式人工智慧(AI)建構 1 個基礎大腦活動模型「腦語言模型(Brain Language Model,BrainLM)」,並在今(2024)年國際表徵學習大會(International Conference on Learning Representations,ICLR)進行發表。透過模擬大腦的活動,探討大腦功能與人類行為及腦部疾病的關聯。阿卜杜拉博士(Dr. Chadi Abdallah)指出,傳統的數據分析工具無法完全捕捉到這些活動的動態變化,而生成式 AI 技術能夠更深入了解並預測大腦活動。

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6700 小時 fMRI 訓練資料,造就模型微調與零樣本推理能力

BrainLM 的特點是使用長達 6,700 小時的功能性磁振造影(fMRI)資料進行自監督遮罩預測訓練,藉由大量資料為基礎,使模型能有效執行微調和零樣本推理任務(Zero-shot Inference Tasks)。良好的微調能力可以有效預測臨床變數與大腦未來的狀態,而零樣本推理將有助於識別出潛在的功能網絡,建構出可解釋的大腦活動表徵。

BrainLM 的模型架構受到大型語言模型的啟發,採用符合大腦活動時空特性的 Transformer 框架進行自監督學習訓練。模型專注於重建大腦活動的遮蔽部分,有助於理解大腦內部複雜交錯的非線性互動。

值得注意的是,該模型採用一種電腦模擬擾動提示方法(in silico perturbation prompting  approach),藉由最佳化擾動函數,可以模擬大腦活動對假設情景的反應,篩選出對改變模型預測大腦狀態影響最大的 fMRI 特徵。BrainLM 為分析和理解大規模大腦活動數據提供 1 種類似「鏡頭(Lens)」的新框架,使其能更有效地解釋未見過的數據。

建構 fMRI 多疾病預測模型,提升藥物開發效率並降低成本

在實際應用中,研究人員將 BrainLM 微調,並在預訓練模型上附加一個多層感知器(Multi-Layer Perceptron,MLP),藉此預測 fMRI 數據中的各種臨床變數,如年齡、創傷後壓力症候群(PTSD)和焦慮症分數。

此外,BrainLM 利用來自 40,000 名受試者高達 80,000 次的掃描數據,建立 1 個不限於特定疾病數據的大腦活動基礎模型。此模型的開發相比傳統腦科學研究,尤其在臨床試驗方面,所需的數據規模與成本顯著降低。例如,在憂鬱症藥物開發臨床試驗中,如果先使用 BrainLM 模型精準篩選可能受益的受試者,有機會將開發成本降低一半。

BrainLM 在多種掃描器和族群樣本中的表現皆優於既有的其他模型,尤其在預測憂鬱症、焦慮症和創傷後壓力症候群(PTSD)嚴重程度方面,效果可超越其他未採用生成式 AI 的機器學習方法。研究者計劃建構一個「廣效」模型,如果可以預測其他大腦相關疾病,未來極有可能在精神疾病治療或神經外科手術方面發揮重要作用。

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參考資料:
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.09.12.557460v1.full.pdf

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