“2018 Nanostring 癌症免疫治疗—全方位伴随式诊断暨用户分享研讨会”由冷泉港生物科技股份有限公司（以下简称冷泉港）主办，于 5 月 4 日假台大医院国际会议中心盛大登场。过去，癌症治疗以化疗和标靶治疗为主，二者虽然可抑制癌细胞生长，但疗效皆仅能维持一段时间。近年来，免疫疗法透过崭新的抗癌机转研究，能提升病人长期存活率，为癌症治疗带来新契机。其副作用虽较少，但使用过程中仍需仔细监测相关症状及检验数值。因此，如何提升免疫治疗的效果，例如：寻找可预测疗效的生物标志或合并其他治疗，是当前努力的方向，也是热门研究议题。此次大会邀请 Nanostring 原厂科学家、生物资讯专家及癌症治疗之众多学者及医生，共同交流，分享彼此的研究，激荡更多火花。
冷泉港的张瑞湖总经理开场致词表示，希望透过核心实验室的搭建，将冷泉港的服务包含精准医疗、小动物活体影像以及微生物菌相研究等相关的产品推广普及，建立更大、更完整的数据库，协助国内研究人员开发进展、作为医师诊疗与用药参考、提供生技公司及药厂，作为诊断平台或是药物开发之用。
张瑞湖 总经理
冷泉港产品经理陈诗蕙博士，分享 Nanostring 在精准医疗开发临床检测系统的应用，探讨如何将临床研究开发成未来能改变临床指引的有利工具。她形容 Nanostring 为新精准定量的黄金标准，其再现性（reproducibility）高、专一性高是 Nanostring 的极大优点，拿一份 RNA 样本做多基因表现的定量，发现再现性很好，因此对于珍贵的临床样本，其实就无须再做技术重复；而且，Nanostring 在各国皆有相关研究报导，以加拿大儿童脑瘤伴随式诊断之研究成果为例，研究员将样本与设计的 RNA 探针寄到美国与瑞士，同时进行 Nanostring 的实验，在三个不同地点、不同操作人员最后皆获得一致的结果，表示该技术适用于跨国多中心的临床研究。此外，Nanostring 以机器自动化取代大多数人工，可避免人为误差的产生，且比起次世代定序（next generation sequencing, NGS）技术，可减少约六个工作天的工时，省时又省力。
陈诗蕙 博士
NanoString 亚太区营运总监 Paul Rasmussen 博士于演讲中特别提到两大主题，其一为 Nanostring 的 360 度全方位研究肿瘤免疫学与免疫疗法的基因表现套组（PanCancer IO 360 Gene Expression Panel），可用于开发药物伴随式诊断、临床研究之治疗策略，以及协助研究人员发表论文。Nanostring 适用于多种研究领域，包含：免疫、感染、基因表现、3D biology (DNA、RNA、蛋白质侦测技术) 等等，而在肿瘤领域的部分，当今最热门的免疫疗法，目前仅 25-30% 的病人有效，而影响其疗效的三大因素有：肿瘤细胞、肿瘤微环境（tumor microenvironment, TME）以及免疫反应（immune system’s response），因此该套组致力于侦测上述三个面向，期望以更全方位的角度帮助提升免疫治疗之成效，造福更多患者。Dr. Paul Rasmussen 也提及另一项开发重点“digital spatial profiling”，与过往实验方式不同之处在于，撇开仅看单一目标的做法，透过 barcode 的特殊设计，可一览多种目标，甚至可读取所有能侦测到的讯号，让研究者得以更全面的纵观检测结果。
Paul Rasmussen 博士
辅仁大学附设医院一般外科主任、辅仁大学医学系副教授黄其晟医师从临床角度切入，探讨乳癌多基因标记的现况与未来。乳癌在台湾至今依然是发生率第一的癌症，且好发于高社经地位的女性，因此更受重视。乳癌以基因表现区分不同分子亚型较其他癌症来得更早与完整，乳癌在筛检及辅助治疗已有长足进步，但在临床预后及风险预测仍有发展空间，而目前可透过一些多基因表现检测，帮助医师与病人共同制定合适的治疗策略。基因标记分成单基因与多基因，单基因检测可用于遗传性乳癌的筛检，而多基因标记则可用于乳癌病患复发风险预测。临床上中等风险的病患，即可用多基因检测作为选择治疗方式的参考。但黄医师也强调，基因检测并不是决定乳癌治疗必要条件，也不完全适用于所有乳癌病患。
黄其晟 医师
台大医学院临床医学研究所的王弘毅教授表示，以往 B 肝病毒（Hepatitis B virus, HBV）的研究，多着重在后天免疫（adaptive immunity）的部分，而先天免疫（innate immunity）在此扮演的角色仍旧不甚清楚。B 肝病毒的清除能力与年龄有很大的关系，若 在一岁前感染，约有九成会病患会成为 B 肝带原者。成年后感染，则仅有不到 5% 会成为慢性带原者。本次研究借由建立各年龄的慢性 B 肝病毒感染小鼠模型，探讨 B 肝病毒对先天免疫的影响。发现 B 肝病毒引起 的先天免疫主要会改变肝脏巨噬细胞（kupffer cell）与发炎反应相关的单核球 （monocyte）之间的关系，两群细胞有如平衡跷跷板，在未感染时，由巨噬细胞维持平衡，一但感染 B 肝病毒后，巨噬细胞会下降，而单核球会大量进入肝 脏，并分泌促进发炎反应的细胞激素（cytokine）协助清除 B 肝病毒感染。然而， 在年纪小的小鼠模型则看不到该现象，无法激起足够的免疫反应来清除病毒， 因此产生高比例的带原。由此可知，年龄对先天免疫清除 B 肝病毒的能力有很 大的影响。王弘毅教授表示，希望能将实验结果，回归应用到人体医疗层面， 帮助更多 B 肝患者。
王弘毅 教授
国卫院癌症研究所的张忆寿名誉研究员，长年投入癌症生物资讯领域，此次他以“如何善加利用高通量的体学资料（making good use of high-throughput omics data）”为题，与听众分享高通量技术运用于研究的重点及经验。张研究员指出，随着高通量技术的问世，相应的资讯分析也有所进展，改变了研究人员选题的方向，使得研究过程的重点与以往不同，例如：在癌症生物标记的研究上，从过去找寻特定基因到针对整个讯息传递路径、再到看免疫细胞组成等去探究，带动整个转译医学的发展。其中，张研究员强调，除了选题及样本资料的收集很重要外，后续的分析方法也不容忽视，而第一步的实验设计与选对统计模型（model）是成功的关键。再者，由于收集样本资料时，容易因不相关的因素如取样时间不同、实验材料批次不同，产生批次效应（batch effect）进而影响分析结果，而透过高通量的资料及主成份分析（principal component analysis, PCA）可降低批次效应造成的伪阳性问题。
张忆寿 名誉研究员
国卫院林育如博士后研究员表示，在所有台湾妇女癌症中，乳癌的发生率高居第一。目前临床上分为四种乳癌亚型，包含管腔细胞 A 型 （luminal A）、管腔细胞 B 型（luminal B）、人类上皮细胞生长因子接受器第 2 型（Her2+）过度表现型和基底细胞型（basal-like）三阴性乳癌类等。针对不同病患，作出不同的治疗建议，例如 Her2+ 患者采用 Trastuzumab（Herceptin, 贺癌平）结合化疗，Luminal A/B 患者采用 endocrine 或 endocrine 结合化疗治疗。因此，为了实现乳癌的个人化治疗目标，他们透过 WGS 取得患者的基因体数据，接着建立染色体图谱以及基因图谱，再借由PanCancer IO 360平台，探讨乳癌中肿瘤、肿瘤微环境和免疫反应之间的交互作用。未来，该平台可望应用于免疫治疗的评估，以及监测癌细胞对于免疫治疗的反应。
林育如 博士后研究员
国卫院癌研所副所长洪文俊教授指出，胰脏癌患者的五年存活率为所有癌症中最低。接着提到，每个癌症通常会有 3～6 个驱动基因突变（driver gene mutation），而在胰脏癌患者中，KRAS 和 p53 为最常见的基因突变，各占 90% 和 50 %，另外常见突变类型为 WNT 讯息传递路径相关基因，例如 AXIN1、RNF、APC 等。随后，他们建立二组胰脏癌动物模型，其一为 KRAS、p53 突变（KPC），其二为 KRAS、p53 及 APC 突变（KPA），进行不同药物治疗的研究。过去研究显示，血小板衍生生长因子（platelet-derived growth factor, PDGF）在胰脏癌形成过程中，也扮演重要角色，而 Src 讯息传递路径也会影响 PDGF 所诱导之肿瘤恶化，因此他们让 KPA 和 KPC 老鼠使用 Src 抑制剂 dasatinib，结果发现，dasatinib 治疗 KPA 老鼠效果佳。洪教授特别指出，该研究让医师能给适当的患者，给予对的药，这就是精准医学的精髓。此外，洪教授也指出免疫治疗对胰脏癌的效果非常差，2015 年研究指出，免疫疗法客观反应率（OPR）很低，最主要的原因为肿瘤微环境影响。
洪文俊 教授
国卫院癌症研究所的江士升助研究员指出，口腔癌为癌症的前五名，复发患者的存活率不高，找出这些复发率高的患者的生物标记（biomarkers）相当重要，所以国卫院也建立口腔癌基因体图谱。而生物标记的获得方法可分为基因层次（ gene level）或讯息传递路径层次（pathway level）。他们的研究团队采用讯息传递路径分析方法（pathway analysis，又称 gene sets analysis），分析特定肿瘤微环境的路径或是功能变异。更具体地说，他们采用的是基因集富集分析方法（gene set enrichment analysis, GSEA），能检测基因集合而不是单个基因的表达变化，预期得到更为理想结果。他也提到，样品预备的 protocol 及 SOP 相当重要，例如，从新鲜冷冻样本、福马林固定石蜡包埋样本（formalin-fixed, paraffin-embedded, FFPE）萃取核酸的过程中，可能会有些许 的人为操作误差，而NanoString平台对于这种误差似乎较不敏感。此外，他更表示，后续的数据处理及校正、注意肿瘤免疫浸润（immune infiltration score）、 探针设计（probe design）等都是需要特别留意之处。
江士升 助研究员
台大医院肿瘤医学部陈伟武主治医师表示，现今免疫疗法大多是指免疫检查点抑制剂（immune checkpoint inhibitor），临床上免疫检查点抑制剂，例如合并使用 CTLA-4 抑制剂 ipilimumab 与抑制剂 nivolumab 治疗黑色素瘤患者的效果优于单独使用 nivolumab 治疗。然而，并非将所有的免疫疗法结合起来都有不错的效果，例如吲哚胺 2,3 – 双加氧酶 （indoleamine 2,3-dioxygnease-1, IDO-1） 免疫抑制剂治疗黑色素瘤有不错的效果，但 PD-1 结合 IDO1 组合疗法的第三期临床试验结果却不如预期。也发现某些 PD-L1 表现缺失的患者对 PD-L1 抑制剂仍有些许效果，这是未来可进行探讨研究的方向。陈医师接着表示，IFN-ϒ 在免疫调控中，扮演相当重要角色，若患者的 IFN-ϒ 表现佳，再用 PD-1 抑制剂于黑色素瘤会比较有效，在各种肿瘤癌症分析中，不能只分析 T 细胞，仍须分析其他细胞，例如抗原呈现细胞、巨噬细胞等。
陈伟武 主治医师
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