高度微卫星体不稳定性（microsatellite instability-high，MSI-H）为癌症遗传变异的特征，主要发生原因是细胞在分裂过程中，修复错误的 DNA 序列有缺陷，导致微卫星体产生重复序列。
近日，Caris Life Sciences 指出，与目前的方法相比，使用次世代定序（next-generation sequencing，NGS）来检测癌症免疫治疗候选患者的 MSI-H 状态，可望更有效且有更高的成本效益，此研究刊登于《Cancer Medicine》期刊。
为了评估 NGS 检测（NGS-MSI）和目前常用的标准 PCR 片段分析法（PCR-FA）检测 MSI的有效性，该研究团队收集 2189 个跨越 26 种癌症肿瘤类型的配对病例（其中 1108 例为大肠直肠癌）进行比较。结果显示，在所有 26 种的肿瘤类型中，NGS –MSI 的灵敏度为 95.8％，其特异性为 99.4％。他们进一步分析发现，在大肠直癌患者中，NGS-MSI 的灵敏度高达 100%，而且其特异性也高达 99.9％。他们更进一步指出，NGS-MSI 能检测出 23 种癌症类型的 MSI-H 状态。此外，与 PCR-FA 最大不同之处，MSI-NGS 不需要透过正常组织与肿瘤组织进行比较，患者仅需最少的生物检体（biopsy）就能进行 MSI-H 检测。
在医师指导患者是否要接受免疫检查点抑制剂（checkpoint inhibitor）之前，评估患者的 MSI 是相当重要的。因此，该研究团队研究 MSI 状态与其他已知生物标记之间的关系，该生物标记包含肿瘤突变负荷（tumor mutation burden，TMB）和 PD-L1。结果显示，在 11348 例病例中，MSI-H、高度 TMB 以及 PD-L1 阳性各占 3%、7.7%、25.4％。然而，在 MSI-H 病例中，低度 TMB 占 30%，PD-L1 阳性占 26%。对所有三种生物标志物都呈阳性占 0.6%。值得注意的是，三种生物标记互相重叠的情形，会因癌症类型而有所差异。
Caris 医疗总监 W. Michael Korn 博士指出，传统上，MSI 检测需要正常和肿瘤组织，但 Caris 的 NGS 检测只需要肿瘤组织即可进行，因此减少了患者的负担，并缩短检测结果往返的时间。除了 MSI 状态，其 NGS 方法还能提供关于 TMB 以及数百种临床相关基因改变的讯息。
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参考资料：
1. Vanderwalde A, et al. Cancer Med. 2018 Feb 13. doi: 10.1002/cam4.1372.
2. https://www.curetoday.com/articles/nextgeneration-sequencing-platform-efficiently-detects-msi-status
3. https://www.prnewswire.com/news-releases/caris-life-sciences-announces-published-results-validating-its-next-generation-sequencing-platform-to-detect-microsatellite-instability-and-comparing-immunotherapy-associated-biomarkers-across-11000-patients-300598720.html
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