日本学者发表世界最大规模肝癌全基因定序为肝癌基因分类

撰文 / Cindy Chen

原发性肝癌是全世界导致死亡的第二大癌症，而全球肝癌患者有超过 70% 集中包括日本，台湾在内的亚洲地区，即所谓的肝癌高盛行率区。根据日本国立癌症研究中心在 2013 年的统计，日本每年约有四万人罹患肝癌，约有三万人因肝癌而死亡。

肝癌的主要感染原因为慢性的肝炎病毒感染。进展过程大多源自于肝脏受到 B 型 (HBV) 与 C 型肝炎病毒 (HCV) 的感染形成慢性肝炎。如果没有定期追踪检查与有效的病程控制，肝炎病毒所引起的慢性发炎就会使肝硬化，甚至因而转变成肝癌。在亚洲与非洲地区，约有 70% 的肝癌是由 B 型肝炎所引起，相对的在日本则是有 60% 的肝癌源自于 C 型肝炎。

一般来说，癌症是源自于基因异变的疾病，它的形成往往由数种致癌基因的活化或数种抑癌基因的功能丧失所累积而成。因此，如果能够深入了解癌症的基因，便有机会能够将研究成果应用在癌症的新药开发与个人化医疗。

自 2008 年以来，国际癌症基因联盟（International Cancer Genome Consortium; ICGC）招集了十六个来自不同国家的癌症及基因科学家着手进行癌症基因定序研究，致力于超过五十种癌症的基因解析，而此次研究亦是 ICGC 的计画之一。此研究以日本理化研究所 (Institute of Physical and Chemical Research; RIKEN) 的中川英刀与藤本明洋博士为首，联合日本国立癌症研究中心及东京大学医科学研究所的研究人员参与而完成。

在这项研究中，研究人员使用次世代定序法 (Next Generation Sequencing; NGS) 与东京大学人类基因分析中心的超级电脑 SHIROKANE (Supercomputer SHIROKANE) 为三百例的日本肝癌患者进行个人全基因体定序 (Whole genome sequencing analysis; 全基因组定序)。总数据量高达七十兆个序列，囊括患者的个人全基因体的正常及癌症肿瘤的基因序列。

延伸阅读：日本第一三共药厂宣布展开罕见疾病新药第一期临床试验

根据 2016 年四月发表于科学期刊 Nature Genetics 的论文表示，每个肝癌肿瘤细胞约有一万处显示异常。除了既知的癌症相关基因以外，研究团队更发现十个以上目前从未发现的肝癌突变基因，使目前所发现的肝癌基因异常总数攀升至近四十个。

研究团队接着依据临床背景与基因变异的特征，将肝癌基因分为六个不同的基因变异种类。在深入研究之后，发现肝癌病患在手术后五年内的生存率，会因为所带有突变基因的种类不同，遍布为 0 至 80％不等。

例如带有 MACROD2 基因的病患大约有八成在治疗后的五年内并未发现任何癌症肿瘤转移或再发的迹象，而带有 ARID2，PBRM1 基因的病患则是全数有转移或再发的迹象。另外，带有抑癌基因 TP53 异变的肝癌患者群则是属于病况较不乐观，生存率约为 20％的类别。

(图为日本理化研究所于日本神户的计算科学研究机构)

透过日本时报 (The Japan Times) 的电话访问，日本理化研究所的中川英刀博士指出，目前市面上匮乏肝癌标靶治疗药物，而唯一通过 FDA 核准上市肝癌标靶治疗药物只有 Sorafenib (蕾莎瓦) 一种。因此，期许此次的研究结果能够对肝癌分子标靶治疗能够有所贡献，更期许在很快的将来，癌症病患能够依照自己的基因来量身订做有效的治疗方法。

延伸阅读：日本东京大学宣布展开抗复发肺癌疫苗临床试验

参考文献
1.Fujimoto et al “Whole genome mutational landscape and characterization of non-coding and structural mutations in liver cancer”, Nature Genetics (http://www.nature.com/ng/journal/vaop/ncurrent/full/ng.3547.html)
2.http://www.japantimes.co.jp/news/2016/04/12/national/science-health/massive-whole-genome-study-finds-six-types-of-liver-cancer/#.VxctoGMkiqA
3.http://www.riken.jp/pr/press/2016/20160412_1/
4.http://www.sankei.com/life/news/160418/lif1604180020-n1.html

图片来源：
1.Cindy Chen
2.https://en.wikipedia.org/wiki/RIKEN#/media/File:RIKEN_AICS_20120810-001.jpg

分享此文：