人类蛋白质体计画最新报告:已确定蛋白占 9 成

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2010 年,人类蛋白质体组织(Human Proteome Organization, HUPO)启动“人类蛋白质体计画”,利用大量数据,将科学家、临床医生、产业、机构和知识库(knowledgebase, KB)合作伙伴联系起来,想要了解蛋白质之间如何交互作用,身体和环境如何影响健康,进而改变医学的实践方式,并且为全球合作、数据共享、品质保证和增强基因体编码蛋白质体的准确注释建立一个国际框架。

近日,由 HUPO 刊登于《Nature Communications》的最新研究报告指出,人类蛋白质体计画已覆蓋了 17874 种蛋白质(PE1*),占人类所有蛋白质的 90.4%,其余蛋白位于 PE2~PE4 阶段。

*根据 neXtProt 定义蛋白分类,可分为 PE1 (已确定蛋白)、PE2(转录阶段)、PE3(从同源性推断)、PE4(推测存在蛋白)、PE5 (预测可疑或不确定的蛋白质)。

了解人类蛋白质体学有助于精准医学的进步。举例来说,基因体突变可能有助于了解更多有关癌症的资讯,但它们不一定会引起蛋白质体学变化,因此仅使用基因体数据可能有所限制。结合蛋白质体学和基因体数据,可以帮助缩小导致肿瘤形成的突变,并帮助更快地找到治疗标靶。

另外,蛋白质体计画也有助于 COVID-19 潜在疗法的开发,如 SARS-CoV-2 蛋白质组和被感染细胞的蛋白质体,了解二者之间如何交互作用、改变,可望理解某些细胞和个体对 COVID-19 具有更强的适应能力。反之,另一些更弱。这些基因体无法回答上述问题。

HUPO 将持续提升人类蛋白质组计画的蛋白质品质和数量,以及鼓励将来建立更多的多体学研究,并促进单细胞蛋白质体学等创新技术的发展。

延伸阅读:东亚第一个非吸菸肺腺癌深度蛋白体学综观研究!

参考资料:
1. Nat Commun 11, 5301 (2020). https://doi.org/10.1038/s41467-020-19045-9
2. https://cbr.ubc.ca/mapping-human-proteome/

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