人物专访 – 台湾行动基因 陈华键 执行长

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One-fits-all这个概念是在以前了,现在应该是 Multiple drugs for subpanel!

这次 Gene Online 很荣幸的采访台湾的癌症分子资讯公司ACT Genomics行动基因, 并与行动基因执行长陈华键博士与王帘读处长一同探讨他们如何结合先进的基因体学技术与生物资讯并将它们运用于癌症的临床治疗。

行动基因创立起源和动机

陈博士: 行动基因整个公司的营运是在2014年7月开始。我跟另外一个 founder 陈淑贞陈老师在成立这家公司之前,我跟陈老师两人是 TaiGen太景的创始科学家, 在2006年我们离开太景到长庚担任生医系副教授,刚开始是做 Microarray,后来在2010到2011年的时候,我们开始接触 Next-Generation Sequencing (NGS) 次世代定序这个技术,而在做NGS的时候与很多医生有合作关系,也做了实际的检体,发现这个技术实际上是很强大的,它可以让癌症病患的检体资讯很快解读出来,而很多医生也表示,这些讯息对他们未来病患的治疗甚至对用药的选择都很有帮助,因此觉得除了长庚医院的医生,台湾还有很多癌症的病患应该也有相同的需求,这就是整个行动基因的起源和动机。

公司的团队结构

公司的经营团队现在约有50人,其中有12个是博士学历的科学家,有三分之二的员工至少硕士学历的,所以整个公司整体的的素质在台湾生物科技产业来讲,是非常高的。那这50个人里面最值得一提的就是,除掉我们这几个创始科学家以外,我们的Chief Medical Officer 医务长,钟添坤医师,扮演着把分析和治疗两部份整合起来的关键角色。此外行动基因一年内已拿到ISO 17025的认证。然后我们预计今年底通过美国最高等级的CAP认证,我们同时也在申请ISO15189医学实验室的认证,估计明年初之前会拿到这个认证。

要做一个癌症基因图谱的提供者和推手

所以行动基因,我们定义我们的工作为 cancer genomics 的 provider,就是把病患他癌细胞里面可能的这些基因突变,做标靶的定序,针对某一些基因,某一些特别重要的位点做很深度的一个定序。定序完了以后,这个的资讯我们再把它转换成医学上头用药的参考,或者医生拿这个资讯做为病人愈后的参考,这个就是我们行动基因要做的也正在做的。所以我们定义我们是 cancer genomics 的 provider,癌症基因图谱的提供者。
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行动基因的主要服务对象

我们主要的服务对象大概有三个范畴:

第一个范畴是癌症病患,如果医生觉得他有这个需求,希望能做基因检测来帮助医生对他的用药、或者用这些资讯来帮助愈后的管理,我们会提供这方面的服务,所以癌症病患是我们主要的诉求。

  第二个,这个技术非常适合拿去帮忙研究的医生和科学家,当医生他过往已经收集了很多重要的临床检体,他想回答一些医学上头的问题,或是找寻检验的生物标记,以及预测药物的有效性,都可以借由这个技术。因此医生这部分的研究计画或者是学界的研究计画,是我们第二个方向。而目前医学中心和二十几个医生我们都有合作案在进行,其中包含台大、长庚、北荣、高医、高长、基隆长庚等,而这部分我们也跟医生从事protocol design,同时也希望能透过研究型的计画让医生知道NGS这个技术究竟可以帮忙到什么样的程度,当他们看过了这些数据、这些资料,他们未来就比较有信心去建议他的病患接受基因检测,用基因检测的资料来做为未来治疗的依据。

第三个,基因的检测实际上对抗癌药物的研发的这一些药厂或生技公司起了一个很大的帮忙,举例说罗氏药厂最近花了非常多的钱买下 Foundation Medicine,Foundation Medicine 这一家生技公司在2009成立,他们的方向和我们非常相似,他们专注于在癌症的病患做癌症基因图谱,他的平台可以测约三百个基因,这代表罗氏看上这部分产生的癌症基因的数据,未来对药物的研发很有作用。所以我们的第三个的服务对象就是药厂或生技公司,而行动基因在最近这段期也的确跟台湾很多的药厂谈到合作计画,而除了国内,我们最近也跟国外的的 ASLAN Pharmaceuticals 药厂合作。对于他们标靶治疗的药物,在做临床测试的时候,有些病患的反应特别好,因此他想要了解这个病患为什么对他的药反应特别好,这个在学术界我们称为 exceptional responder,透过对 exceptional responder 做全基因的一个分析以后,你有机会找到机制,知道为什么哪些基因、哪个 pathway 的突变对他的药会特别有效,这个资讯分析出来之后,他临床的第二期、第三期就可以把这样的因子加到他的临床里来,那这个是他们想做的。

浅谈 Exceptional Responder

关于 exceptional responder,现在美国国家癌症研究院就有一个 exceptional responder 的计画,专门收集美国的临床医生,他们在他的诊疗里面,如果有一个病患对某一个药超过预期的好,那这个他就定义为 exceptional responder,他们也是利用定序来分析他的机制。这个人有什么样特别的基因讯息,如果我们收集足够多的资讯,那这些个例未来就变成是这个药它真正有效的对象或者是族群。因为有可能你平常一个族群做出来,可能只有8%有效,可是大部分都没效,可能少数几个就是非常有效,这几个非常有效的原因就是你未来想要去了解的。
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精准医学重新定义癌症治疗

精准医学这一部分稍微做一个很简单的介绍,尤其是在癌症这一部分。癌症早期是以化疗为主,化疗用药都是依照癌细胞生长或者是代谢的这些标的来做,所以没有办法非常清楚地去区分癌细胞跟正常细胞的问题,同样的它也没有办法清楚地去区分不同基因突变所可能产生的不同作用,因为它是依照癌细胞的一些基本的特征,所以相对之下,它的副作用比较高,它并没有去考虑个体之间基因的问题,所以它的有效性就只有侷限在某一部分的人。

我们都知道癌细胞本身是由基因突变所引起,从过去二、三十年的研究的理论基础已经非常成熟。而我们定义大概有三群重要的基因来控制这个,一个是叫做 Oncogene,那这个是会促进肿瘤的群组,我们所熟悉的像 EGFR,这个在 Iressa、Tarceva的肺癌标靶里面,又比如说 Herceptin 的这个标靶 HER2 这些基因,这些都是属于Oncogene,现在我们体内已知的 Oncogene 大概差不多将近一百个左右;另外还有二、三十个是 Tumor Suppressor Gene,顾名思义是抑制癌细胞生长的基因;另外还有一部份基因是跟我们的染色体的稳定度有关,所以它属于 DNA Missmatch Repair,就是说DNA的修复能力。所以这三群基因构成整个肿瘤生物学最重要的 driver genes,癌症基因的突变就是产生在这些上头。

比较重要的就是,每一个人突变的基因不会完全是一样的,这个基因有可能在大肠癌突变,也有可能到乳癌突变,也有可能到口腔癌里面去突变。目前癌症临床医生, 病理医师对癌症的分类是依照他的肿瘤分类,这个是肝癌、这个是大肠癌,可是另外一个层次就是说,我们也可以从分子的角度来分类,这个是 EGFR 突变的肿瘤,这个是 HER2 突变的肿瘤,这个是 PICK3A 突变的肿瘤,相同的分子机制有机会可以用相同的药,比如说像有些药物是跟 DNA 的那个修复基因有关,那在卵巢癌可以用、在乳癌也可以用,那同样的像一些 EGFR 的这个抑制药物,最早是用于肺癌,那现在口腔癌如果是相同的机制,口腔癌也是可以用。所以这些就慢慢地会变成跟过去比较不太一样的一个过程。

以前药厂希望所谓 blockbuster 的药,一个药出来,我可以用于所有人,实际上从过去经验来看我们都知道,这种药大概只有对药厂有利,对病患、对整个医疗经济基本上是没有好处的,因为从基因学的分析,我们就已经知道每一个癌症病患实际上是heterogenetic的,开始慢慢的有几个成功案例,就是所谓的标靶治疗,比如说 Glivec他只有 BCR-ABL,有 BCR-ABL 的 translocation, Glivec 就可以处理的非常好; HER2只要有 overexpression, Herceptin 就可以有效,如果 EGFR 它是属于activation的突变,有好几个突变可以让它导致 activation,Iressa、Tarceva就会有效,如果它突变在其他地方就没有效,再比如说 ALK,ALK的 translocation在整个肺癌它只有大概8到10%,可是如果8到10%的病患有这个 ALK,你给他给相同的药他就有效。One-fits- all这个概念是在以前了,现在应该是 multiple drugs for subpanel。  

总而言之精准医学我觉得是未来一条路,然后就是在这个过程里面,他一定是要很多不同的整合,有医生、有媒体,有实际像生技公司的,然后最重要还有要有一些药厂他愿意支持,而政府的支持也是不可或缺的。

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