荣阳基因体中心于 2000 年成立，为台湾最早的基因体中心之一，多年来，致力于包括生物资讯、定序、微阵列及与荣总合作的影像系统等尖端计画，也成为国家的核心设施。
中心主要分为两个部分，一是核心设施，二是研究团队。核心设施目前由林奇宏老师带领多位非常有经验的成员，包含花嘉玲经理、刘孜孜博士等，作为和学术、临床连结的服务平台。研究团队则是由阳明大学为主的基础研究学者和台北荣总为主的临床医师及研究员组成。研究主体涵盖了口腔头颈癌、大肠直肠癌及肺癌等，并以疾病作为组成研究团队的基础，包含了临床医师、癌症生物学家、基因体科学家、免疫学家，把肿瘤免疫和基因体科学在团队内整合。
荣阳基因体研究中心 杨慕华主任
从传统基因体引领世代发展
中心成立至今经过了几次转型，早期以高通量产出的产能，在硬件设备和人员建置皆相当完善的基础下，陆续开启了许多基因体计画，包括人类的第四号染色体、黑猩猩、及蔡世峰老师的克雷白氏菌解码等，从无到有的 de nove sequence。
早期最重要的研究，即为蔡世峰老师与北荣陈威明医师的合作成果。当时陈威明医师发现了一个股骨头缺血性坏死的家族，由蔡世峰老师筹划染色体定位及基因选殖，成功找到致病基因，这个成果也登上生医类的顶尖期刊 — 新英格兰杂志，是相当重要的里程碑。
在徐明达老师任内，开始了台湾第一个表观基因体计画，发现许多表观基因体的基础调控机制，建立表观基因体的分析平台，并撰写成为教科书分享成果。从探查未来的方向、透过与研究单位的合作发展，再将相关技术教育推广出去的技术研发流程及分享，也是中心的目标之一。
国立阳明大学 荣阳基因体研究中心
2008 年之后，较偏向计画导向，由吴国瑞老师及杨慕华老师带领癌症研究团队，以基因体为平台做肿瘤转移的研究，并有多篇成果发表于《nature cell biology》及《cancer cell》等期刊。而在老化方面也由跨中心研究成员蔡亭芬教授全球第一个发现与老鼠寿命相关的长寿基因CSID2，更做了许多杰出的研究及专利。
从早期蔡世峰老师在传统定序及基因体研究成果，到徐明达老师在表观基因体上的系列研究，及现在癌症、疾病导向的时代，由吴国瑞老师及杨慕华老师在癌症转移方面、蔡亭芬老师在老化方面的研究，都是荣阳基因体中心发展的足迹。
资讯共享计画应由国家主导
大约四到五年前，在基因体医学国家型科技计画（NRPGM）的时代，有讨论过是否要将所有拿国科会经费的计画研究结果数据资料上传到国网中心，但在当时会议上的意见分歧，未制定这样的条款。荣阳基因体中心历年来都希望这些资料可以一再地被应用，但是以核心设施的角度，必须考虑到使用者的隐私和顾虑，为避免造成使用者的恐慌，在数据库公开方面态度较为保守。中心认为，应由国家制定规范，例如规定凡是由科技部计画支付经费的研究结果都应该上传公开，在这样的制度之下，再由阳明等基因体中心担任执行单位的角色，才能达到资讯共享而使用者没有顾虑的状态。
从高中生到临床医师的教育训练
国家核心计画的任务之一，就是教育推广。荣阳基因体中心在教育层面上可以分为学生和科研团队两大方向。学生的部份包含在硕士班新生暑期学分班、医学系的医师科学家课程中所开设的理论课程与实务操作教学，另外也有国高中生每年的参访活动。而对于广大的科研团队，教育的部份更是投入许多心力。开设许多教育训练课程，包含了 pathway、microarray、NGS、pyrosequence、Q-PCR 等相关的资料分析训练课程，也会和厂商配合，请国外原厂或相关人士来讲解训练，帮助科研团队在拿到数据后的分析应用。除此之外，也配合计画办公室，做全国性的巡回，以及生技月等活动的参与。近年来也受到许多学校系所或学程邀请举办基因体相关讲座。
这些课程之外，基因体中心还有一个重要的任务，就是去协助临床医师完成基因体研究，一方面将检体数据做到让医师能够判读而不会太艰深，另一方面也帮助克服医师在进入科研领域、基因体科学时会遇到的困难。从 2015 年底开始，核心设施整并生物资讯核心，提出一个目标：“使用者导向的服务”。跳脱过去纯粹收检体、分析后提供数据资料，现在往前跨一步，从资料的收集、分析到实验的规划开始与研究者携手合作，开启“线上预约门诊”的服务，中心内有许多研究员或资深技术员都有专家门诊时间，上网预约挂号就能提供实验咨询的服务，若问题非单一专家可以解决，也有联合门诊的时间。从最开始的规划、评估，如何在经费不足或检体不足的情况下达到最好的研究成果，也避免拿到数据才发现分析方式的选择错误，提高研究成功机率。
荣阳基因体研究中心 花嘉玲经理
肿瘤免疫与农业应用
杨慕华老师在 2013 年接任阳明免疫学研究中心，2014 年接任基因体中心，同时担任两个中心的主任，也是荣总的肿瘤科医师。身兼多重角色的杨老师，看见了免疫与肿瘤必然的发展趋势，即开始着手于这方面的研究。研究团队未来的方向也以利用基因体科学为平台，与临床结合，做肿瘤与免疫相关的研究为主。
核心设施希望能走向自给自足的单位。主要业务分为与学校合作，成为校内的仪器中心；荣总合作，成为荣总的分子实验室；第三部分则是相当特别的，非人医的部份。非人医的部份包含了农业和商业的应用。由于核心设施的主持人林奇宏老师目前担任新北市卫生局局长，发现有许多民生问题是可以透过高通量的基因体分析去解决，譬如说基改食品、掺伪等食品检验项目。因为现在的高通量技术，可以用过去 1/7 的钱、1/5 的样品、1/10 的时间，去做出一样的效果。有业者表示，其实政府对于食安的规范是严格的，但没有这样的检验机制去让执法者可以严格执行。荣阳基因体中心就协助成立这样的平台，再将资讯散播出去。除了帮助食安等民生问题的检验之外，提供基因体育种技术用以取代基改植物，也是应用方向之一。以基因体为平台的肿瘤免疫、成为学校的仪器中心、荣总的分子检验实验室和致力于农业及民生问题筛检，是荣阳基因体中心未来前进的方向。
下篇预告：
台湾大学基因体医学研究中心致力于跨领域整合、研究发展与服务平台，以及生医大数据的应用，并且在癌症与感染疾病、生物资讯、体学(Omics)融合及国际合作，都有非常亮眼的成果! 更多关于台湾大学基因体医学研究中心的报导，敬请期待基因体中心系列专访(三)：台湾大学基因体医学研究中心 体学(Omics)融合与跨领域对化。
首图来源：http://genoinfocore.ym.edu.tw/?page_id=111
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