次世代定序(NGS) 能否成为白血病复发诊断工具?

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急性骨髓性白血病(acute myeloid leukemia, AML)患者在接受化疗后,其骨髓中残存著微量癌细胞,此状况称为微量残存疾病(minimal residual disease, MRD),而且 MRD 是一个很好的预后因子。多参数流式细胞仪(multiparameter flow cytometry, MFC)或 PCR 为目前检测 MRD 的主要方法。随着对 AML 基因体的认知增加以及技术越来越进步,也有几个小型成人世代研究(小于 75 人)也开始使用次世代定序(next-generation sequencing, NGS)来检测 MRD,但大型世代研究却尚未报导。

近日,荷兰伊拉斯姆斯大学(Erasmus University Rotterdam)Jongen-Lavrencic 教授的研究团队使用 NGS 来定序 500 名 AML 患者的基因序列,其中包括 15个基因的外显子以及 39 个致癌热点基因,而这 54 基因组别与 AML 突变有关。接着分别使用 NGS 和 MFC 来分析其中 340 名患者的样品的 MRD。结果县市,对于大多数患者(69.1%)获得了一致的结果,没有 MRD 的患者,其复发率最低;有 MRD 的患者,其复发率最高。

该研究团队也表示,MRD检测结果呈现阴性,并不能保证患者不会再度复发,而该研究中,在接受 NGS 和 MFC 双向检测且结果呈现无 MRD 的患者中,有 26.7 % 出现复发。

随着方法学的进步,NGS 和 MFC 来检测 MRD 阳性或阴性的患者比例可能会发生变化,但有鉴于每种检测方法都有它的局限性,仅使用一种检测方法不太可能提供最大的预后讯息。例如,该研究使用 NGS 检测 MRD,仍有 10 % 患者无法检测出上述的 54 个基因组。

美国华盛顿西雅图Fred Hutchinson癌症研究中心 Roland B. Walter博士与 Frederick R. Appelbaum 博士指出,该研究提供了令人信服的证据,证明 NGS 检测 MRD 的讯息能补充 MFC 和 PCR 检测方法的预后讯息,是相辅相成的。然而,目前在仍然很缺乏来自 MRD 检测讯息的前瞻性研究来作为医师临床诊断及决策的证据,未来需更多大型临床试验加入。

延伸阅读:次世代定序 NGS 的临床运用

参考文献:
1. Nature Reviews Clinical Oncology (2018) DOI:10.1038/s41571-018-0040-0
2. N Engl J Med. 2018 Mar 29;378(13):1189-1199.

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