染色质重塑与癌症大哉问!以 BAF/PBAF家族为例

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BAF/PBAF 复合体是 4 个非常重要的人类染色质调控因子家族之一。它们像电机的关键机器,利用 ATP 磷酸水解酶(ATPase)进行水解,调控 DNA 在组织蛋白上的滑动或使 DNA 脱离组织蛋白,最终或者使 DNA 变得致密而阻碍转录,或者使 DNA 变得松散而促进转录,进而影响基因的表现。

近十年来,对 BAF/PBAF 复合体的研究越来越多,它们的突变与约 20% 的癌症(如胰脏癌、胃癌和黑色素瘤)有关。然而,这些突变是如何影响 BAF/PBAF 复合体的功能以及如何影响癌细胞发展,至今仍有许多未解开的问题。

近日,犹他大学健康医院的研究团队透过 COSMIC 癌症数据库和酵母菌研究模型,来探讨BAF/PBAF 的人类染色质重塑机制,相关研究结果刊登于《Molecular Cell》。

该研究团队将染色质改构蛋白 BRG1 与癌症相关的错义突变放入酵母 RSC 重塑剂的直系同源 Sth1 ATPase中。这些 ATPase 包含功能丧失(loss-of-function mutation, LoF)、或者功能改善(gain-of-function mutation, GoF)等二种没酶,大大改善了体外 DNA 转运效率和核小体重塑。

再来,他们确定了由几个 Sth1 结构域的关联形成的结构“集线器”,该集线器调节 ATPase 活性和 DNA 转运效率。值得注意的是,所有与癌症相关的突变和所有功能丧失性突变在物理上均位于集线器中不同的相邻区域,这些区域分别专门调节和促使 DNA 易位。例如,与癌症相关的 GoF 和 LoF 错义突变分别映射到每个区域。另外,仅 GoF 突变增加核小体滑动和染色质可及性,在癌细胞中,有早熟的染色质可及性。

延伸阅读:ATAC-seq着色非编码DNA 绘出人类癌症染色质图谱

参考资料:
1. Molecular Cell, 2020; 80 (4): 712 DOI: 10.1016/j.molcel.2020.09.024
2. https://healthcare.utah.edu/huntsmancancerinstitute/news/2020/11/scientists-discover-roles-for-a-cellular-motor-in-cancer.php

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