欧盟启动“HCA | Organoid”计画!建立类器官细胞图谱,促新药开发

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单细胞技术帮助人们能用新的视角来理解细胞生物学,也进一步促进个人化医学和再生生物学的发展。2016 年 10 月,由麻省理工学院和哈佛大学布洛德研究所(Broad Institute)、维康信托基金会桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)和维康信托基金会邀请许多国际专家讨论如何建立“人类细胞图谱”(Human Cell Atlas, HCA),包含免疫细胞、大脑和神经系统中的各种细胞、上皮组织的细胞,以及肿瘤微环境内的癌细胞、周围正常细胞和免疫细胞。

欧盟透过其《欧盟地平线 2020 框架计画》(EU Horizon 2020 Framework Programme)拨款 500 万欧元成立一个名为“HCA | Organoid”的研究计画,主要是将单细胞分析和类器官(organoid)技术结合,期望能进一步验证类器官可作为人类生物学的忠实模型,然后促进开放性的“类器官细胞图谱”(Organoid Cell Atlas)开发,进而促进罕见遗传性疾病、复杂多因素疾病和癌症的转化研究和药物开发。

HCA | Organoid 首先将着重于建立单细胞转录体、表观基因体,以及人类类器官和健康捐献者配对的主要组织的时间序列成像。该计画将从 100 个个体衍生的人脑和大肠直肠类器官进行广泛的特性分析,以找出群体差异,并且建立以疾病为中心的研究对照组。单细胞图谱将汇整到公共的类器官细胞图谱入口网站(Organoid Cell Atlas Portal)中,该入口网站将提供友善的接口给用户来使用类器官单细胞数据来连结人类样本。该科学资源将支持多项概念性验证(proof of concept, POC)研究,例如,聚焦于脑类器官的遗传性癫痫(genetic epilepsy)疾病模型、癌症类器官模型,以及透过肠道类器官来找出其疾病相关的遗传性差异。

该计画将由 8 个研究机构组成,包括奥地利科学院分子医学研究中心(Research Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences)和其分子生物科技研究所、马西玛公主儿童肿瘤学中心( Princess Máxima Center for Pediatric Oncology)、荷兰研究机构 Hubrecht Organoid Technology、瑞士弗雷德里希・米歇尔生物医学研究所(Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research)、德国癌症研究中心、欧洲生物资讯学研究所以及欧洲研究与计画办公室等。团队成员包含类器官技术、单细胞分析、高级影像成像和生物资讯学方面的专家。

首先将关注大脑和大肠直肠类器官的单细胞特征分析,然后建立一个开放且合作性的网络平台供研究人员使用,以便对多种人类类器官的单细胞特征进行归类。

参考资料:
1. https://www.broadinstitute.org/news/international-human-cell-atlas-initiative-gets-underway
2. https://cordis.europa.eu/article/id/422049-new-eu-funded-research-project-hca-organoid-toward-a-single-cell-atlas-of-human-organoids-for

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