新冠病毒入侵前就阻绝?藏身棘状蛋白内的分子扮演关键角色

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 9 月 21 日,又一篇新冠病毒(SARS-CoV-2)研究登上《Science》期刊,布里斯托大学(University of Bristol)研究团队发现,SARS-CoV-2 棘状蛋白结合位点(binding pocket)中的游离脂肪酸(Free fatty acid, FFA)是影响病毒入侵宿主细胞的关键,若能开发针对结合位点的小分子抗病毒药物,可望消除新冠病毒。

SARS-CoV-2 棘状蛋白中藏关键

SARS-CoV-2 的棘状蛋白在人体感染中扮演重要角色,病毒能在接合细胞表面后开始入侵,并透过自我复制的功能扩大感染程度与范围。布里斯托大学研究团队用低温电子显微镜(electron cryo-microscopy, ryo-EM)以接近原子大小的分辨率观测 SARS-CoV-2,并利用 Oracle 的云端运算技术,建构 SARS-CoV-2 3D 模型,对棘状蛋白的分子组成进行观察。

结果发现 SARS-CoV-2 棘状蛋白位点的亚油酸(linoleic acid, LA)是管控 SARS-CoV-2 扩散的潜在关键,不仅因科学家在部分 COVID-19 重症患者的血液中发现亚油酸缺乏的情形,研究也观察到内含亚油酸的蛋白质空腔(pocket)皆出现在高传染力的冠状病毒中,例如 SARS 冠状病毒(SARS-CoV)和中东呼吸症候群冠状病毒感染症 (MERS-CoV)中。

亚油酸是一种游离脂肪酸(free fatty acid),对细胞运作来说不可或缺,人体只能靠饮食吸收,无法自体生成。它不仅是人体调节发炎作用与免疫系统的重要元素,也是人类保持肺部细胞膜运作不可或缺的脂肪酸。此外,亚油酸能透过稳定棘状蛋白的结构,降低 SARS-CoV-2 与 ACE2 的交互作用,借此降低 SARS-CoV-2 的传染力。该研究团队 Imre Berger 教授指出,“若未来可以发现比亚油酸更能结合蛋白质的的物质,我们就可让 SARS-CoV-2 处于传染力近乎 0 的状态。”

细胞试验验证亚油酸与 SARS-CoV-2 感染的关联性 

先前研究指出,50 至 100 μM 亚油酸能影响冠状病毒入侵细胞与自我繁殖。也因瑞德西韦为 COVID-19 临床试验中首个出现效益的抗病毒药品。因此,该研究团队为证实亚油酸抗 SARS-CoV-2 的实际效用,在人类内皮细胞(endothelial cells)感染 SARS-CoV-2 前,分别采用 20、64、200 nM 的瑞德西韦(remdesivir)和 50 μM 的亚油酸。

结果显示,加入亚油酸后,瑞德西韦能更加有效的抑制 SARS-CoV-2 复制功能;此外,他们透过萤光染色法(Immunofluorescence Assay)鉴定细胞感染程度结果在细胞感染后 96 小时,可见增加 50 μM 亚油酸阻绝感染的成效。

抗病毒疗法新方法?病毒入侵前就阻绝

布里斯托大学生物化学院 Christiane Schaffitzel 教授表示,在新冠疫苗未开发成功前,人类需要另一种抵抗 COVID-19 的手段。“爱滋病耗时 30 年最终得出小分子抗病毒药物的鸡尾酒疗法。而我们在 SARS-CoV-2 棘状蛋白可药物化位点中的发现,很可能带领抗病毒药物进入新的世代,使病毒入侵细胞前有效抑制并灭除。”

延伸阅读:棘状蛋白与 ACE2 结合有 10 种结构变化?破解新冠病毒感染过程

参考资料:
1. Science  21 Sep 2020: eabd3255. DOI: 10.1126/science.abd3255
2. https://www.bristol.ac.uk/news/2020/september/spike-protein.html
3. https://www.youtube.com/watch?v=EMaKFcpV5wg&feature=emb_logo&ab_channel=UniversityofBristol

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