植物界的 p53:SOG1 扮演 DNA 损伤修复指挥官

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当植物 DNA 受损时,SOG1 基因扮演总指挥的角色,它与植物细胞中各种遗传分派者协调以建立有效的 DNA 损伤反应,进而保护和修复植物。然而,尚不清楚有哪些基因是分派者,也不清楚 SOG1 如何与它们相互作用来监督 DNA损伤反应。

近日,由 Salk 研究院的 Julie Law 助理教授所率领的研究团队解开了这个谜团。他们发现 SOG1如同一个钜细靡遗的指挥官,直接指派每个分派者的任务。他们首先将阿拉伯芥(Arabidopsis thaliana)暴露在强电离辐射下,产生DNA双链断裂。然后,他们进一步发现,约 2400 种基因表现随着 DNA 的损伤而上升或下降,几乎所有的基因都受 SOG1 影响。其中,约 200 个(8%)基因被 SOG1 直接活化。上述结果,帮助人们划出复杂的基因调控网络的第一层,并且表明 SOG1 正在扮演更加间接的监督角色。该研究发表《Proceedings of the National Academy of Sciences》。

为了理解上述大约 2400 个基因在 DNA 受损时所扮演的角色,该研究团队将它们的数据输入到一个 DREM 软件中,让 DREM 辨识 24 小时研究期间内有相似表现模式的基因。最终,他们找出 11 组基因能在植物对 DNA 损伤时不同时间范围内采取不同的相对措施。

该研究团队于未来计划表现图谱研究与 DNA 损伤反应相关的新因子的交互作用,并继续探索 SOG1 直接或间接控制的基因网络。

该研究除了提示借由保持基因体稳定性改善植物健康的策略外,也为其它物种中 DNA 损伤保守反应的研究提供了重要的线索。因为动物中具有类似 SOG1 总指挥角色的基因,比如 p53 基因,它是一种癌症抑制基因,能有效修复及保护 DNA 损伤以预防癌症。

延伸阅读:守护细胞的神盾局特工 保护 DNA 断裂并协助修复

参考资料:
1. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2018; 201810582 DOI: 10.1073/pnas.1810582115
2. https://www.eurekalert.org/pub_releases/2018-12/si-trd121318.php

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