平價基因定序先驅!加州新創 Ultima Genomics 獲 6 億美金融資推動 100 美金的定序服務

0

美國加州基因定序新創公司 Ultima Genomics 於 5 月 31 日宣布獲 6 億美金的融資可用於推動僅需 100 美金的平價基因定序;另外也將與生物資訊學(bioinformatics)公司 Sentieon、 Google DeepVariant 合作,共同利用深度學習(deep learning)開發能大規模的變種基因體辨識系統,盼能提供更具成本效益的個人疾病診斷與風險預測。

細數回顧 deCODE 25 年來的基因組與人類多樣性發現(基因線上國際版)

Ultima 新平台技術能降低基因組成本至 100 美金

Ultima Genomics 的創始人兼執行長 Gilad Almogy 指出道:「DNA 為大自然的儲存每種活體生物訊息的媒介,然而現有的科技卻讓我們無法通盤了解此複雜資訊。」

有鑒於生物學的複雜與動態性,臨床科學對於基因組的研究有無盡的需求,目前科學界也已在基因定序取得了巨大的進展,包含人類基因組計劃(​​The Human Genome Project )、千人基因組計劃(1000 Genomes Project)等。儘管如此,由於受限於研究和疾病診斷的成本,個人基因定序目前對大多數人來說仍是遙不可及的檢測。

根據美國國家人類基因組研究所(National Human Genome Research Institute)的數據指出,人類基因組分析的成本於 2001 年高達一百億美金,不過儘管價格隨著科技的進步與普及率持續往下降,至今價格大約介於 400 至 1000 美金不等。

每組基因組數據所需耗費的成本(圖片來源:National Human Genome Research Institute)

創立於 2016 年,Ultima 以擴大基因體數據的規模為宏願,並希望能在不改變效率與精確度降低基因組定序成本,提供基因組市場一個更平價的選擇。在過去五年中,Ultima 成功開發出一種全新、高量能(throughput)且低成本的定序平台,並於今日正式浮出檯面。

Ultima 更宣布已與麻省理工學院(MIT)、哈佛大學等多家頂尖研究機構合作,透過旗下平台進行全基因組定序、單細胞定序和癌症表觀遺傳學等多項研究,預計於下週的基因組生物學技術進展(AGBT)會議(2022 年 6 月 6-9 日)上公布首批數據成果。Gilad Almogy 還表示,此次開發的基因定序平台僅為起頭,往後將不斷努力降低分析成本,直至可被各醫療保健系統常規使用。

與 Google DeepVariant、Sentieon 合作,加入深度學習與演算法

除基因組計劃外,Ultima 也在同日宣布已與 Google 旗下的 AI 深度學習工具 DeepVariant、美國精準醫療數據公司 Sentieon 合作。在機器學習與高精確的演算法的幫助下,Ultima 將可提升處理基因定序數據的效能,使其在大規模運作下仍能保持高度準確和速度為基因定序開創新頁。

目前 Ultima 旗下的新型高通量 NGS 設備 UG 100 雖還在早期階段,但預計將能以 1 美金/Gb 的成本替客戶生產高質量的定序數據。Ultima 與兩公司合作的最新數據也將於 AGBT 期間公布。

延伸閱讀:NGS 基因定序龍頭 Illumina 設點台灣,強化新冠防疫與精準醫療領域

參考資料:
1. https://www.prnewswire.com/news-releases/ultima-genomics-partners-with-sentieon-and-google-deepvariant-to-deliver-high-performance-variant-calling-301558347.html
2. https://www.prnewswire.com/news-releases/ultima-genomics-delivers-the-100-genome-301557756.html
3. https://www.genome.gov/about-genomics/fact-sheets/Sequencing-Human-Genome-cost

error: 注意: 右鍵複製內容已停用!