人物专访_探索生技寇景怡总经理_精准医学的应用与愿景

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探索生技总经理寇景怡从国外基因检测公司的经验,谈到基因检测准确度必须提高到临床诊断等级,达到精准治疗的目的。以下为专访摘要:

能定序基因就能做基因检测吗?

由于基因检测的准确度目前还没有官方判定标准,所以我还是持比较保留的看法。举例来说,BRCA突变基因检测目的是预测乳癌或卵巢癌的遗传风险,要在BRCA1、BRCA2这两个这么大的基因里找出一个致病的突变点,就如同要在一本百科全书中找出一个错字般的繁复。技术上第一个瓶颈是必须能在短时间内将整个基因正确、完整地读取;第二个瓶颈是要从读取结果中找出有问题的地方,实验室更要将读取结果与数据库进行比对,经过精密的计算才能找出有问题的基因位点,内行人都了解‘基因变异数据库的品质才是关键’。当实验室说没有找到变异基因,不一定代表结果真的就是阴性,因为有可能是数据库不够齐全所以比对不到;当实验室说找到了变异基因(variant),也不一定代表结果就是阳性,还要知道这个变异到底是一个致病突变基因(mutation)还是一个多型性基因(polymorphism)才能决定报告是阳性还是阴性。因此,如果没有一个很精准的基因变异数据库,遗传突变基因检测会比较难达到临床诊断所需的精准等级。

选择基因检测该注意什么

在做遗传突变基因检测的时候,我们要问的应该是VUS rate(Variants of Uncertain Significance)有多少? VUS rate越低代表准确度越高,而基因检测公司要如何降低VUS rate呢?答案是“需要一个好的基因变异数据库”,以安吉莉纳裘莉所采用的纳斯达克上市公司Myriad Genetics为例,它是目前全球最大BRCA基因检测公司,成立20年来服务对象已经超过150万,BRCA基因检测的VUS rate仅约0.6%-1.6%,是目前准确度最高的遗传突变基因检测公司。它能够成为全球医生信赖的基因检测公司,主要原因是拥有数量最多、品质最高的独家变异基因数据库。也许你会有个疑问,不是有公共基因数据库吗? 为何Myriad Genetics这20年来还陆续投入将近一亿美金建立自己的数据库?但事实是,Myriad Genetics只使用自己的独家数据库,并不使用公共数据库,因为连美国卫生研究院也同意公共基因数据库的错误率偏高,虽然在2014年开始投入4年2400万美金的预算在提高公共基因数据库品质,但是目前准确度仍然不足以达到临床诊断等级。

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最新研究显示,多基因检测能提高30%以上的准确度

以往我们以为影响乳癌卵巢癌会不会遗传的基因只有BRCA基因,但是越来越多证据显示不只有BRCA基因,还有其他好几个基因都跟乳癌卵巢癌遗传有关联。因此不能只看一个两个基因,而是该有关联的基因都检查Myriad Genetics确定有25个基因跟8种遗传性的癌症有密切交错的关系,研究结果显示,使用Myriad Genetic公司的 MyRisk多基因检测,可以比单一基因检测提高30%以上的检测率。Myriad发现做BRCA但是没有筛到的病人,如果再用MyRisk去做筛检,发现大概有三成的人,是因为BRCA1/BRCA2以外的基因发生突变而导致乳癌或卵巢癌。

基因检测用在精准治疗

对已经罹患乳癌的人,我们用那斯达克股票上市公司Genomic Health的OncotypeDX检测来分析乳癌复发机率与化疗效益。Oncotype DX检测报告并不是告诉病患乳癌是否会遗传,而是分析乳癌肿瘤基因,决定乳癌肿瘤对于化疗的预后评估,这就是个人化医疗的概念,所有的乳癌肿瘤都是独一无二的,透过基因检测才能达到精准治疗的目的。研究显示,OncotypeDX检测结果小于18分的患者,接受化疗的效益不明显,也就是多做化疗并没有明显降低乳癌复发机率,2015年最新的大型前瞻性(Prospective)证据显示,OncotypeDX检测结果分数小于11分的患者,没做化疗只做5年荷尔蒙治疗的复发机率不到1%,这结果对于不想做化疗的患者是很有用的证据。一般民众有一个错误的观念,以为得癌症一定要做化疗,但是包括美国国家癌症联合中心NCCN、美国临床肿瘤协会ASCO、英国国家健康与临床卓越机构NICE等国际医学组织都已经正式认可医师可以采用OncotypeDX基因检测来决定病患是否需要接受化疗。

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台湾女性乳癌好发年纪比西方人早10年,发生的高峰约在45岁到55岁之间,这个年纪的女生大多照顾小孩与工作两头忙,一但做了化疗生活一定会受到影响,所以这类的年轻乳癌患者,建议可以做基因检测确定是否真的需要化疗。

基因检测用在伴随式诊断

各大药厂无不卯足全力在癌症标靶药物的研发,顾名思义,标靶药物就是在癌肿瘤细胞找到能阻断生长的位点,再利用药物加以阻断,如同标靶一样,直接命中红心,以达到阻断癌细胞生长的目的。“生命会自己找到出口”,同样的癌细胞也会,甚至生命力比正常细胞更强,当原本的生长路径遭遇阻断时,它会产生突变,另启生长路径,这也是为什么很多标靶药物在使用初期有不错的效果,但一段时间后效果却越来越不显著,这个时候基因检测就可以提供重要的资讯,帮助医师在短时间内更换药物,找出更适合的取代药物替换已经渐渐失效的药物,我们称之为伴随式诊断。2015年Guardant Health公司宣布取得关键技术,能从血液检体找出循环肿瘤细胞之游离DNA(tumor cell free circulation DNA),从中解读肿瘤基因并提出用药分析,医师可在短时间内根据液态切片(liquid biopsy)的分析结果,替病人选择最有效的标靶药物。
中国人有一句话叫“对症下药”,而基因检测的好处就是帮助医生做到“对症下药”。美国总统欧巴马在2015年国情咨文演讲中宣布了美国将展开一项高达2.15亿美金的新计画—精准医疗计划(Precision Medicine Initiative),该项目资助美国癌症研究中心(NCI) 高达7千万美元在肿瘤基因学研究,希望能开发更多更有效的肿瘤治疗方法,我们也期待有更多的资金投入台湾医疗研究,同时搭配台湾的健保制度,让健保资源做更有效的利用。

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