非侵入性胎儿染色体基因检测（NIPT/NIFTY/NIPS）是利用孕妇血液中的胎儿游离DNA筛检胎儿异常，主要被用来筛检三种常见的体染色体异常：唐氏症(T21)、爱德华氏症(T18)、巴陶氏症(T13﹚2015 年英国Diana Bianchi教授和研究团队首度发现，从非侵入性胎儿染色体基因检测检测异常 ，出现多重染色体倍数变异的情况（ Multiple Copy Number Variation） 或检测无效的案例中，有数名为罹患恶性肿瘤的确诊个案，初步证实孕期肿瘤会造成 NIFTY/NIPT 检测异常的结果。
2019年4月一篇跨区域、多种族、大规模数据的研究成果发表在Nature系列期刊《Genetics in Medicine》，收集来自新加坡、伊朗、中国、香港、台湾、丹麦、西班牙和斯洛文尼亚等地超过193万例的临床研究，验证在非侵入性胎儿染色体基因检测（NIFTY/NIPT）出现多重染色体倍数变异的现象和母体肿瘤有关。此研究由包含 BGI、台湾基康（Genehealth）在内的30多个医疗/研究机构共同收案合作。
193万例接受非侵入性胎儿染色体基因检测的孕妇当中，有639位的分析结果出现多重染色体异常的拷贝数变异（Copy Number Variation;CNV）讯号，扣除97位失联无法追踪的个案以外，此篇研究共追踪访查了542位受检者，其中有41名受检者在进行详细的医学检查之后，经由医师确认诊断罹患恶性肿瘤（癌症）， 其中，确认为乳癌者占10位（24.4%）、淋巴癌9位（22%）、肝癌9位（22%）、消化道癌症（胃癌）4位（9.8%）、大肠直肠癌3位（7.3%）、卵巢畸胎瘤1位（2.4%）、鼻咽癌（NPC, Nasopharyngeal Carcinoma）1位（2.4%）、肺癌1位（2.4%）、平滑肌肉瘤（Leiomyosarcoma, LMS）1位（2.4%）、生殖细胞瘤（dysgerminoma）1位（2.4%）、子宫颈癌1位（2.4%）。此外，还有有4位受检者则是确诊患有子宫肌瘤（Leiomyomas）、1位受检者患有卵巢巧克力囊肿。
41位确诊罹癌的受检者中，统计有8位（19.5%）为第二期癌、9位（22%）为第三期癌、19位（46.3%）为第四期癌，过半检出罹癌的患者属于癌症中晚期，可能因中晚期的肿瘤较大，释放较多的ctDNA，而较容易被侦测出多重CNV的信号。即便如此，也并非所有多重染色体倍数变异（Multiple CNV）的结果都是恶性肿瘤所造成，以本次收案结果统计，639名当中仅有42位受检者确认诊断罹癌，阳性预测率（PPV）仅约7.6%，用来预测母体肿瘤的存在其专一性仍然偏低。
此外，研究团队从542名（41名确诊罹癌，501名未罹癌）追踪访查的受检者当中发现FCNV（Fraction of significant CNVs）数值有非常明显的差异，进而编写成CDP（Cancer Detection Pipeline）算法，其检测敏感性（sensitivity）可达83%、特异性（specificity）达84.2%； 阳性预测率（PPV）与阴性预测率（NPV）则分别为30.1%与 98.4%，相较于仅用多重CNV来预测肿瘤，此套CDP算法将专一性显著提升。未来若检测出异常多重CNV的情况时，可望透过算法的优化，提供临床医师与受检者更加精准的参考数据，用做后续医疗方向参考。
注：FCNV=明显异常出现CNV的游离DNA片段数量/所有游离DNA片段的总数量
| 项目 | 敏感性（sensitivity） | 特异性（specificity） | 阳性预测率（PPV） | 阴性预测率（NPV） |
| 数值 | 83% | 84.2% | 30.1% | 98.4% |
表一、算法优化后各项统计数据
参考文献：
1.Identifying occult maternal malignancies from 1.93 million pregnant women undergoing noninvasive prenatal screening tests. Genet Med. 2019 Apr 12.
2.Sequencing of Circulating Cell-free DNA during Pregnancy. N Engl J Med. 2018 Aug 2;379(5):464-473.
3.Incidental identification of maternal malignancies in two Asian women underwent noninvasive prenatal test. bioRxiv, 2016, 095364.
4.Noninvasive Prenatal Testing and Incidental Detection of Occult Maternal Malignancies. JAMA. 2015 Jul 14;314(2):162-9.
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