新冠變種病毒 Lambda(C.37)於去年 12 月最先在秘魯出現,自 4 月以來秘魯的新冠感染者有高達 81% 為 Lambda 變異株感染,相關確診案例在中南美洲不斷增加,英國也已出現 6 名 Lambda 變異株感染者。
Lambda 變種病毒由 B.1.1.1 病毒株突變而來。6 月 15 日,WHO 已將 Lambda(C.37)列入全球須留意變異株(variant of interest, VOI)名單中。近期一項研究則以巴西首位 Lambda 變體感染者,分析其具有高傳染力的突變特性。成果發表於《medRxiv》。
Lambda 變體 8 個新的突變位點
透過基因定序後,研究團隊發現 Lambda 變體有 8 個新的突變位點。
Lambda 變體和 Alpha、 Beta、Gamma 病毒株一樣,都比原始病毒少了 Δ3675- 3677 基因序列。這段缺少的序列位在 ORF1a 基因片段,ORF1a 與病毒產生特定水解蛋白的功能有關。
此外, Lambda 變體缺少的還有 Δ246-252 這個基因片段 ,研究團隊推論這項變異可能提升其感染宿主的適應性。
在感染力方面, Lambda 變體具有 6 個位點突變(G75V, T76I, L452Q, F490S, D614G, T859N)。其中 2 個(L452Q 與 F490S)位在病毒的受體結合區域(RBD),由於 RBD 是病毒初期感染宿主、結合其細胞表面的構造。F490S 突變會會造成宿主抗體的中和能力降低。
除了上述突變,Lambda 變體也帶有另外 19 個突變位點 ,是在 B.1.1.1 病毒株中已被定義的 。
Lambda 變體的高傳染性需持續關注
鑑於 Lambda 變體在中南美各國的強大傳染力,他們認為其有極大可能被 WHO 升級列為高關注變異株(variant of concern, VOC),但造成其傳染力的因素仍待確認。他們指出 Lambda 變體特有的突變、以及棘蛋白變異,將是未來持續探討的重要因素。
延伸閱讀:Illumina 響應國網中心科技抗疫,免費提供新冠病毒基因定序分析服務參考資料:
1. https://www.news-medical.net/news/20210627/Lambda-lineage-of-SARS-CoV-2-has-potential-to-become-variant-of-concern.aspx
2. https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
3. medRxiv, 2021; https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.06.21.21259241v1
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