2023 歐洲腫瘤學會年會(ESMO 2023)於 10 月西班牙舉行。一直以來,生物標記物是癌症篩檢、診斷、預後追蹤的重要途徑,因此相關研究進展也成為本次會議的一大重點。
透過傳統組織切片檢測生物標記物,具有高侵入性與無法適切反應腫瘤異質性的缺點,近年來隨者液態切片相關研究文獻發表,相關檢測的應用也開始液態切片日漸普及。此次在 ESMO 2023 會議中發表多項高質量的生物標記物研究,而藉由液態切片腫瘤比率(Tumor fraction,TF)與總代謝腫瘤體積比率(Total metabolic tumor volume,tMTV),呈現晚期非小細胞肺癌患者的基因變化與臨床應用之間的重要關聯性,成為此次會議的一個重點。
TF/tMTV 比率與細胞凋亡基因改變相關
Foundation Medicine 在 ESMO 2023 會議中發布 11 篇與高品質生物標記物研究文章摘要,其中血液循環腫瘤 DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)的 TF 生物標記物,在晚期非小細胞肺癌患者中,找到了基因體與臨床應用之間的關聯性。
在血液樣本中發現的 ctDNA 占游離細胞 DNA(cell free DNA,cfDNA)的百分比稱為 TF,取決於腫瘤負荷(tumor burden,TB),透過正子掃描(PET)可以評估 TF 與 TB 之間潛在的基因體特徵。而在一項前瞻性臨床試驗 STING 中,非小細胞肺癌患者在第一線或治療進展後 42 天內使用 FoundationOne®Liquid CDx 檢測並進行 PET 掃描,探討 ctDNA 的TF 與 tMTV 的相關性,以支持液態切片結果的解釋。
tMTV 主要使用 PET 掃描結合 CT 測量的方式,以追蹤劑進行偵測。代謝較為活躍的細胞(特別是癌細胞)吸收追蹤劑的程度也較高,因此當 PET 影像顯示高追蹤劑吸收的區域,表示該區具有較多活躍腫瘤組織,藉此對腫瘤組織的代謝活性進行量化。在 PET 掃描中,會計算稱為標準化攝取值(SUV)的指標,SUV 可以評估放射性追蹤劑在腫瘤組織中的聚集程度。此研究選擇 SUVmax(最大 SUV 值)的 42% 作為閾值,意味只有當追蹤劑吸收量達到或超過此閾值的腫瘤區域會被計入 tMTV 的計算。
研究者篩選出至少有 2.5% 的病人中有出現的基因變異進行分析。在統計分析中,研究人員將基因變異與重排被視為共變數,以考慮腫瘤基因變化對其代謝特性的影響。此外,研究使用 TF/tMTV 比率對數作為依變數,使用多元線性回歸,藉此探索基因變化如何影響 TF/tMTV 的比率,進一步推論不同基因變異對腫瘤特性的影響。
研究對 242 份液態切片結果進行分析,其中 38 份樣本未檢出與臨床相關的基因變異,而其中 17 名患者進一步進行組織分子表徵分析。研究並未發現 tMTV 與 TF 在基線或治療進展期間的顯著差異,這表明不論疾病處於哪一階段,tMTV 和 TF 具有一定的關聯性與代表性。
此外,研究還發現,PET 掃描得出的 TF/tMTV 比率與細胞週期調節、細胞增殖和凋亡相關的基因變化,因為這些基因變化與腫瘤代謝密切相關。因此,除傳統的 TB 測量外,ctDNA 中 TF 也能提供額外臨床資訊,用於指導臨床治療和預後評估。
液態切片可望納入預期治療結果,助力醫病溝通
隨著基因檢測技術進步,學者研究發現愈晚期的肺癌,其基因突變有愈多基因亞型出現,也正因如此,單一切片檢查已無法顯示疾病全貌,所以液態切片更能即時反應腫瘤細胞的基因突變演化,而能表達腫瘤相關訊息的生物標記物便應運而生。
ctDNA 生物標記物最早被發現存在於胰臟癌患者原發腫瘤組織中,主要從腫瘤細胞凋亡、壞死或主動釋放而來,存在於血液和其他體液中。另一項真實世界數據研究證實血漿 ctDNA TF 是一種實用且獨立的預後生物標記物,適用於除了非小細胞肺癌之外的其他三種晚期癌症:轉移性去勢抵抗性前列腺癌(mCRPC)、轉移性乳癌(mBC)和轉移性大腸直腸癌(mCRC)。
綜合臨床觀點,液態切片提供更多的腫瘤生物標記物訊息,將來可望納入醫師與患者的溝通選項之中。
延伸閱讀:產官學合作迎來 NGS 給付,分子腫瘤委員會助力癌症精準治療參考資料:
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