Illumina 发布新型定序系统 iSeq 100 携手 Thermo Fisher 强攻 NGS 市场

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1 月 9 日(美国时间),Illumina 公司(简称 Illumina)发布新型半导体的次世代定序(next generation sequencing,简称 NGS)系统 iSeq 100,该系统已列入 Firefly 计画,并进行后续的开发。此外,Illumina 公司也指出,他们将与 Thermo Fisher 公司(简称 Thermo Fisher)合作,使旗下定序系统与 Thermo Fisher 的 AmpliSeq 检测试剂整合为一新定序系统。

Ilumina 执行长 Francis deSouza 于 J.P. Morgan 健康医疗大会指出,iSeq 100 系统整合了合成定序法(sequencing-by-synthesis)和互补式金属氧化物半导体(complementary metal-oxide-semiconductor,简称 CMOS)检测技术,借由 CMOS 感应器,使定序系统在更短的时间内达到更多的读取次数,因此在几个小时内,系统就能建立几十个数据库。这些创新,将为 NGS 开辟新的市场,包括医院内感染(hospital-acquired infections)的监控、食源性病原体(foodborne pathogens)检测和快速微生物体(microbiome)定序等。该系统目前已于线上预购,将于 2018 年第一季度开始出货。

Francis deSouza 也指出,iSeq 100 占地仅 1 平方英呎,美国售价 19900 美元,但此价格仅限于美国,其他区域价格会有所浮动。每个样品成本在 25 美元到150 美元之间,每个定序产生大约 400 万读取次数或 1 千 200 兆字节的数据,原始读取准确度为 99.8%,而依样品不同,定序所需时间约为 9 小时到 18 小时之间。

AmpliSeq 检测系统主要是透过高度多重的聚合酶连锁反应(polymerase chain reaction)从非常有限的样本中,快速且轻松地标靶 DNA 或 RNA 目标,它是一个非常理想和高效能的 NGS 扩增子(amplicon)定序方法,具有容易操作、高效能和可扩展性的工作流程,以及能够在多个 NGS 应用研究领域皆能提供可信数据。到目前为止,已经有超过 1100 篇使用 AmpliSeq 检测系统的研究刊登于相关科学期刊。

Illumina 与 Thermo Fisher 签订合作协议,客户将能在 Illumina 仪器上使用Thermo Fisher 的 AmpliSeq 技术,但仅供研究使用。Illumina 将以 “AmpliSeq for Illumina” 为名向客户贩售。Thermo Fisher 也能出售 AmpliSeq 检测试剂给自己的定序客户进行研究和体外诊断,并保留在其他 NGS 平台上使用 AmpliSeq 技术的权利。

Illumina 商务长 Mark Van Oene 指出,此次合作让高效能且灵活的扩增子试剂加入至 Illumina 市场导向的定序系统产品组合中,客户就能透过 AmpliSeq 检测试剂,促使他们的定序系统发挥更大的效用。 Thermo Fisher 临床 NGS 和肿瘤学部门经理 Joydeep Goswami 表示,AmpliSeq 技术的标准化对疾病研究带来深远的影响,并且鼓励 NGS 产业之间进行更多合作。透过这项合作协议,更多的科研客户将享受到 AmpliSeq 技术的益处。

延伸阅读:挑战百元基因定序 Illumina 推出新机种 NovaSeq

参考资料:
1. https://www.genomeweb.com/sequencing/illumina-launches-semiconductor-sequencer-partners-thermo-fisher-releases-prelim-earnings
2. https://www.businesswire.com/news/home/20180108006943/en/Illumina-Launches-iSeq-100-Sequencing-System
3.https://www.illumina.com/content/dam/illumina-support/documents/documentation/system_documentation/iseq100/iseq-100-site-prep-guide-1000000035337-00.pdf
4. https://www.businesswire.com/news/home/20180108006946/en/Thermo-Fisher-Scientific-Illumina-Sign-Agreement-Provide
5. https://www.illumina.com/products/by-brand/ampliseq.html

首图来源:https://www.illumina.com/systems/sequencing-platforms/iseq.html

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