秘鲁 Lambda 变种病毒扩散中!为何传染力这么强?

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新冠变种病毒 Lambda(C.37)于去年 12 月最先在秘鲁出现,自 4 月以来秘鲁的新冠感染者有高达 81% 为 Lambda 变异株感染,相关确诊案例在中南美洲不断增加,英国也已出现 6 名 Lambda 变异株感染者。

Lambda 变种病毒由 B.1.1.1 病毒株突变而来。6 月 15 日,WHO 已将 Lambda(C.37)列入全球须留意变异株(variant of interest, VOI)名单中。近期一项研究则以巴西首位 Lambda 变体感染者,分析其具有高传染力的突变特性。成果发表于《medRxiv》。

Lambda 变体 8 个新的突变位点

透过基因定序后,研究团队发现 Lambda 变体有 8 个新的突变位点。 

Lambda 变体和 Alpha、 Beta、Gamma 病毒株一样,都比原始病毒少了 Δ3675- 3677 基因序列。这段缺少的序列位在 ORF1a 基因片段,ORF1a 与病毒产生特定水解蛋白的功能有关。

此外, Lambda 变体缺少的还有 Δ246-252 这个基因片段 ,研究团队推论这项变异可能提升其感染宿主的适应性。

在感染力方面, Lambda 变体具有 6 个位点突变(G75V, T76I, L452Q, F490S, D614G, T859N)。其中 2 个(L452Q 与 F490S)位在病毒的受体结合区域(RBD),由于 RBD 是病毒初期感染宿主、结合其细胞表面的构造。F490S 突变会会造成宿主抗体的中和能力降低。

除了上述突变,Lambda 变体也带有另外 19 个突变位点 ,是在 B.1.1.1 病毒株中已被定义的 。

Lambda 变体的高传染性需持续关注

鉴于 Lambda 变体在中南美各国的强大传染力,他们认为其有极大可能被 WHO 升级列为高关注变异株(variant of concern, VOC),但造成其传染力的因素仍待确认。他们指出 Lambda 变体特有的突变、以及棘蛋白变异,将是未来持续探讨的重要因素。

延伸阅读:Illumina 响应国网中心科技抗疫,免费提供新冠病毒基因定序分析服务

参考资料:
1. https://www.news-medical.net/news/20210627/Lambda-lineage-of-SARS-CoV-2-has-potential-to-become-variant-of-concern.aspx
2. https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
3. medRxiv, 2021; https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.06.21.21259241v1

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