用 CRISPR 编辑肠道菌!微生物疗法降低癌症免疫疗法副作用

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癌症免疫疗法是近年热门的癌症治疗之一,该疗法透过检查点抑制剂,来阻碍癌细胞干扰人体免疫系统,大幅提升癌症治疗品质。然而,使用检查点抑制剂产生的毒性却不容小觑,患者也容易出现严重副作用。而有趣的是,有研究指出,人体肠道菌丛中有特殊菌种与治疗产生的毒性和治疗结果息息相关,

德州大学安德森癌症中心(MD Anderson Cancer Center)日前与丹麦生技公司 SNIPR Biome 宣布合作,将使用 CRISPR 基因编辑技术,来开发微生物癌症疗法,降低免疫疗法的不良反应。

CRISPR 编辑微生物基因体的挑战

人体复杂的微生物生态系由上兆个微生物组成,过去科学家曾透过加入好菌、减少坏菌尝试改变微生物的组成,但发现要永久改变特定的微生物组几乎不太可能。因此他们将脑袋动到 CRISPR 的身上,基因编辑微生物的基因体,来提升特定菌种的效能或降低种类。不过这却面临 2 大挑战,一是微生物经过基因编辑后,很难生存下来;二来,肠道微生物难以在实验室培养,所以要开发出可编辑该微生物的 CRISPR 是难上加难。

SNIPR Biome 深耕 CRISPR 编辑微生物的技术,可精准的灭除特定微生物种,同时也保持其他菌种的正常运作。

特殊微生物种与免疫疗法的不良反应相关

安德森癌症中心曾在 2021 年 7 月于《Nature Medicine》发表一篇研究,分析晚期黑色素瘤患者族群,他们正使用可标靶 CTLA-4 与 PD-1 的免疫检查点抑制剂;结果显示有一群特殊的肠道菌与免疫不良反应高度相关,所以只要能标靶该菌种,就有望降低免疫疗法的潜在毒性,进而提升患者治疗品质。

本次合作一共分 2 阶段,首先是厘清该肠道菌的样貌与种类,再来是用 CRISPR 开发微生物疗法,而研发重点是提升免疫疗法的安全性与维持疗效。该药物预计会进行至临床前试验,有机会的话会进入人体试验。

安德森癌症中心的癌症射月计画

在安德森癌症中心的癌症射月计画(Cancer Moonshot)中,该中心在 2021 年的后半年也与其他 2 间生技公司合作癌症疗法开发,分别是美国的 Blueprint Medicines Corporation(Blueprint Medicines),以及新加坡的 Hummingbird Bioscience(Hummingbird)。

2021 年 7 月,安德森癌症中心与 Blueprint Medicines 签下 3 年合作,以加速 CDK2 抑制剂 BLU-222 的临床进程为目标。CDK2 与细胞周期相关,突变的 CDK2 会使癌细胞增生,且是多种癌症亚型的主要驱动因子。而 BLU-222 目前具有标靶多种癌症的能力,且有望成为该类表现最好的药物。

BLU-222 预计会于 2022 年前半年进入第 1 期人体临床试验。

同时,安德森癌症中心也与 Hummingbird 启动多年合作,将推动可标靶 VISTA 拮抗剂 HMBD-002 的临床进度。免疫检查点蛋白 VISTA 在多种癌症患者中被发现,可使肿瘤逃过免疫系统的攻击,而 Hummingbird 开发的​​ HMBD-002 抗体药可抑制 VISTA,进而让免疫系统有效标靶癌细胞。

延伸阅读:CRISPR 基因编辑巨头张锋团队新突破 ,成果连登《Nature》、《Nature Biotechnology》!

参考资料:
1. https://www.mdanderson.org/newsroom/md-anderson-and-snipr-biome-collaborate-on-crispr-microbiome-therapies.h00-159464001.html
2. https://www.nature.com/articles/s41591-021-01406-6
3. https://www.sniprbiome.com/news-press
4. https://www.mdanderson.org/newsroom/md-anderson-blueprint-medicines-collaborate-accelerate-targeted-therapy-blu-222.h00-159462423.html
5. https://www.mdanderson.org/newsroom/md-anderson-hummingbird-bioscience-collaborate-advance-immunotherapies.h00-159462423.html

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