第 3 屆亞太癌症精準醫療論壇於 12 月 1 日「2023 台灣醫療科技展」舉行,日本東部國家癌症中心醫院(National Cancer Center Hospital East, Japan)副長官 Shingo Matsumoto 在論壇中分享日本 MTB 執行策略與現階段進展。作為一個醫學進展先進且超高齡化亞洲國家,許多方法與措施皆是台灣可以師法之對象。
第 3 屆亞太癌症精準醫療論壇:亞太地區 Molecular Tumor Board 的趨勢與挑戰癌症基因體醫學機構公私協力,發揮研究試驗最大綜效
Shingo Matsumoto 首先介紹,依照統計目前日本癌症發病率年度趨勢,每年高達 100 萬起病例,因此專家積極建立癌症基因體醫學聯盟,共商並研擬治療之道。從 2018 年 8 月第一次工作會議開始,到 2019 年 6 月全面基因體分析 (CGP)臨床實踐與公共保險落地結合,藉由日本各個公私組織攜手合作,將跨域資源互通有無,共同建制更完整的網絡系統。
例如,癌症基因醫學(Cancer Genomic Medicine,CGM)核心、樞紐和合作醫院系統,例如日本厚生勞動省(Ministry of Health, Labour and Welfare,MHLW)認證的 CGM 醫院,囊括 13 家核心醫院、32 家樞紐醫院與 211 家地區醫院,所有這些合作網路醫院,都可以進一步提交實體腫瘤或血液樣本進行 CGP 測試,進而集成日本當地癌症樣本共建臨床資料平台。
C-CAT:推動癌症基因醫學與臨床試驗的創新中心
Shingo Matsumoto 接著舉例,癌症基因體學與高階治療中心(Center for Cancer Genomics and Advanced Therapeutics,C-CAT)的成立宗旨是支援癌症基因醫學、共享臨床和基因體資料與促進臨床開發和試驗。旗下建置臨床基因資料庫(Clinico-genomic database)與癌症知識資料庫(Cancer knowledge database),經過資料使用審查委員會審查核准後,即可提供給研究機構、製藥公司、臨床實驗室進行資料庫建設,協助藥物與診斷發展。
自 2019 年 6 月至 2023 年 10 月,登錄 C-CAT 計劃的案例達到 64,047 人次,橫跨癌症種類包含主流 10 種癌症(結腸/小腸、胰腺、膽道、乳腺、胃食道、前列腺、卵巢、肺部、軟組織與子宮)與 6 項較罕見癌種(頭頸部、腦部、膀胱、皮膚、腎臟與甲狀腺)。在透過專家小組獲得匹配療法的可及性層面顯示,自 2019 年 6 月至 2022 年 6 月,共收錄 30,822 個案例,其中有 13,713(44.5%)的病人獲得候選基因型匹配治療建議,其中有 2,888(9.4%)的病人進一步接受專家小組推薦的基因型匹配治療。
LC-SCRUM-Asia:跨國合作推動非小細胞肺癌研究的亞太聯盟
Shingo Matsumoto 進一步詳細解釋日本最大型的肺癌基因體研究計畫 LC-SCRUM-Asia 的架構和合作模式。成員國包含日本與台灣等東亞國家的醫療機構,此外,還有全球製藥、診斷與新創公司參與,皆向 LC-SCRUM 資料中心提交樣本與臨床資料,LC-SCRUM-Japan 和 LC-SCRUM-Asia 收取合約與參與費用後(涵蓋病人招募、身份鑒定以及治療與診斷開發),進行分析並提供報告,同時也會進行資料共享。在私營公司方面,PREMIA 進行資料中心運營、資料庫建設、臨床試驗與伴隨式診斷開發。LSI Medicine 負責基因體分析。而 Temporal LDM 公司則專注於臨床資料收集。
Shingo Matsumoto 繼續說明目前 LC-SCRUM-Asia 第四階段的施行範圍與參與機構。在 LC-SCRUM-Asia 計劃中,針對非小細胞肺癌(NSCLC)進行研究試驗,共有 183 個機構參與,遍布 40 個行政區域,其中有 152 個機構獲批准。在 LC-SCRUM-TRY 計劃,共有 128 個機構,遍布 36 個行政區域,其中有 113 個獲批准。而 LC-SCRUM-Liquid 計劃,則有 165 個機構,分佈 39 個行政區域,共 115 個獲批准。顯示參與機構的廣泛與普遍性。在台灣地區,共 6 個參與 NSCLC 研究的機構,遍布台北、基隆、桃園、新竹、台中與高雄,例如,台大醫院與林口長庚醫院皆參與其中。
接著 Shingo Matsumoto 分析自 2013 年以來 LC-SCRUM-Asia 研究在病患登記方面的趨勢與累積資料。經過研究統計,顯示從 2013 年開始,病人登記數量呈現穩定的增長趨勢。每當協議修訂(Protocol Amendment)而影響病人登記資料的條件後,登記數量也會隨之產生一定程度的變化。LC-SCRUM-Asia 的資料取自多種檢測方法,包括使用 RT-PCR 和 NGS multiplex panel 產生的病人定序資料。從地區分布來看,台灣地區的病人登記數量在整體資料中占有一定比例,並且隨著時間的推移有所增長,顯示台灣在亞太區精準醫學的積極參與。此外,隨著病人累積總登記數量持續上升,到 2023 年 8 月 31 日已達到 18,521 名病人。這些觀察可能與臨床研究設計、研究活動推廣,以及潛在治療效果有關。
循序漸進,逐步建立泛亞洲跨技術與跨國的基因體資料平台
Shingo Matsumoto 繼續說明 LC-SCRUM-Asia 計劃從 2013 至 2023 年各階段 NSCLC 分子檢測發展,該計劃分為 2 期(Phase),每 1 期分為 2 個階段(Stage)。從 2013 到 2016 年間屬第 1 階段,聚焦檢測非鱗狀 NSCLC(Non-squamous NSCLC),並以 EGFR 基因變異為主,但也涵蓋 RET、ROS1 和 ALK 等基因,使用技術包括即時聚合酶連鎖反應(RT-PCR)和螢光原位雜合技術(FISH)。
第 2 至 4 階段則引入更全面的檢測方法,以覆蓋所有類型的 NSCLC。其中,從 2015 至 2019 年間第 1 期聚焦於目標區間 NGS(Targeted NGS),使用 Oncomine 全面性檢測(Oncomine Comprehensive Assay,OCA)。而從 2019 至 2023 年間第 2 期則進一步引進 Amoy 9-in-1 多基因定量 PCR(multi-gene qPCR)檢測與 Oncomine 精準性檢測(Oncomine Precision Assay,OPA)的目標區間 NGS 方法。隨著時間進行,該計劃持續擴展與更新分子檢測技術,以提供更全面而精準的個人化治療。
截至今(2023)年 8 月 31 日, 已有 18,521 名病人登記參與 LC-SCRUM-Asia。Shingo Matsumoto 分析道,在肺癌檢測的不同類型中,非鱗狀非小細胞肺癌(NSCLC)病患登記數量呈現顯著成長,尤其是從 2015 年開始,使用次世代定序檢測(NGS)的 NSCLC 病人登記數量明顯增加,顯示出新技術引入與對此類檢測偏好度增加。相比之下,鱗狀細胞肺癌(Sq)和小細胞肺癌(Small)類型病人登記數量相對較少,且增長較為緩慢。
而在台灣地區,病患登記數在特定時間點,如 2018 年和 2021 年,出現顯著的峰值,這可能與特定的協議修訂有關。整體而言,這些趨勢反映精準醫療在肺癌治療中的日益重要性,以及 NGS 技術在癌症檢測中逐漸普及。
在時間上,Amoy 9-in-1、OPA 和 OCA 等 3 種檢測周轉時間(TAT)分佈顯示 Amoy 9-in-1 檢測涵蓋 8,095 名病患,TAT 中位數為 4 天,範圍在 2 至 15 天之間,大多數檢測結果在 5 天內完成,顯示出較高效率。OPA 檢測 6,957 名病患,TAT 中位數為 5 天,範圍在 1 至 13 天之間,儘管其分佈與 Amoy 9-in-1 相似,但整體上 TAT 偏長,而大部分檢測仍在 6 天內完成。OCA 檢測 8,602 名病患,TAT 中位數為 19 天顯著較長,範圍落在 10 至 97 天間,許多檢測結果需要超過 10 天,甚至達到 30 天以上。綜合來看,Amoy 9-in-1 和 OPA 的 TAT 相對較短,而 OCA 的 TAT 較長,這對於醫療決策與病人管理來說將是一個重要的考量因素。
OCA、Amoy 9-in-1 和 OPA 變異分析,繪製亞太非小細胞肺癌基因圖譜
分析這 2 期癌症基因驅動因子(Oncogene Driver)檢測結果的變異組成,第 1 期涵蓋 8,602 名 NSCLC 病人,就 OCA 檢測結果顯示,EGFR 變異是最常見的,佔 18%,其中 EGFR exon 20 插入變異佔 2%,EGFR 與 PIK3CA 雙重變異佔 1%。KRAS 變異佔 15%,KRAS 與 PIK3CA 的雙重變異佔 1%。BRAF 變異佔 3%,BRAF 與 PIK3CA 的雙重變異為 0.2%,其他較少見的變異包括 ALK、ROS1 與 NRAS 等。
第 2 期研究則使用 2 種檢測方法。Amoy 9-in-1 檢測數據涵蓋 7,356 名非鱗狀 NSCLC 病患,顯示 44% 樣本未檢測出癌基因,25% 檢出 EGFR 變異,ALK 變異檢出率為 4%,其他包括 MET exon 14 跳躍、RET 和 ROS1 變異也有檢出。而 OPA 檢測數據涵蓋 6,957 名病人,顯示未檢測出癌基因的比例為 40%,EGFR 變異佔 19%,其中 EGFR exon 20 插入變異佔 2%,KRAS G12C 變異佔 4%,其他 KRAS 變異則佔 9%。這些數據反映檢測方法的敏感度、特異性、以及可能的樣本異質性等差異,對於個體化的癌症治療,特別是在選擇標靶治療藥物時,提供重要的參考依據。
LC-SCRUM-AP 將計劃精神拓展,建立泛亞洲肺癌完整基因體研究生態系
亞太地區肺癌基因體篩查計劃(LC-SCRUM-AP)則是 LC-SCRUM-Asia 的延伸,研究將拓展至其他亞洲國家,包含來自台灣、泰國、馬來西亞、越南、新加坡、印尼甚至澳洲等約 20 家機構,以進一步開發肺癌新型標靶藥物。
總體而言,LC-SCRUM-Asia 是一個跨機構與地區的基因體篩查平台,自 2013 年成立以來,專注於推動針對罕見癌症基因驅動陽性肺癌的新型標靶治療發展。該計劃通過基因體篩查將超過 18,000 名肺癌病人納入臨床試驗,催生日本 8 種標靶藥物批准。LC-SCRUM-Asia 特別強調使用快速基因體篩查與多基因 PCR 檢測技術,如 Amoy 9-in-1 和 Genexus/OPA 等,TAT 為 4 至 5 天,對非小細胞肺癌精準醫學發展貢獻顯著。此外,該篩查平台已擴展至包括台灣、馬來西亞、泰國、新加坡和越南在內的亞太地區,以進一步推動亞太肺癌精準醫學發展。
日本癌症基因體醫學與全面基因體分析(CGP)未來的發展任務,包括證明 CGP 測試的臨床效用,如改善藥物可獲得性、增加參與臨床試驗病人數量、引入臨床試驗、升級和擴展研究者發起型試驗(IIT),以及縮短目前為 1-2 個月的 TAT。此外,還需要在品質保證下發展臨床基因體資料庫,包括招募資料收集人員、完善資料收集與品質管理,藉此提供改善癌症治療結果的基石。
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